Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkn3Q8K045 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkn3Q8K045 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkn3Q8K045 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkn3Q8K045 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkn3Q8K045 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkn3Q8K045 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkn3Q8K045 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkn3Q8K045 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkn3Q8K045 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkn3Q8K045 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkn3Q8K045 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkn3Q8K045 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkn3Q8K045 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkn3Q8K045 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkn3Q8K045 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkn3Q8K045 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkn3Q8K045 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkn3Q8K045 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pkn3Q8K045 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pkn3Q8K045 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkn3Q8K045 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkn3Q8K045 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkn3Q8K045 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkn3Q8K045 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkn3Q8K045 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkn3Q8K045 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkn3Q8K045 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkn3Q8K045 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkn3Q8K045 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkn3Q8K045 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkn3Q8K045 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkn3Q8K045 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkn3Q8K045 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkn3Q8K045 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkn3Q8K045 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkn3Q8K045 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkn3Q8K045 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkn3Q8K045 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkn3Q8K045 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkn3Q8K045 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkn3Q8K045 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkn3Q8K045 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkn3Q8K045 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkn3Q8K045 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkn3Q8K045 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkn3Q8K045 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkn3Q8K045 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkn3Q8K045 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkn3Q8K045 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkn3Q8K045 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkn3Q8K045 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pkn3Q8K045 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkn3Q8K045 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkn3Q8K045 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkn3Q8K045 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkn3Q8K045 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkn3Q8K045 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkn3Q8K045 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkn3Q8K045 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkn3Q8K045 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkn3Q8K045 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkn3Q8K045 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkn3Q8K045 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkn3Q8K045 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkn3Q8K045 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkn3Q8K045 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkn3Q8K045 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkn3Q8K045 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkn3Q8K045 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkn3Q8K045 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkn3Q8K045 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkn3Q8K045 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkn3Q8K045 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkn3Q8K045 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkn3Q8K045 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkn3Q8K045 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkn3Q8K045 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkn3Q8K045 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkn3Q8K045 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkn3Q8K045 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkn3Q8K045 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkn3Q8K045 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkn3Q8K045 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkn3Q8K045 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkn3Q8K045 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkn3Q8K045 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkn3Q8K045 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkn3Q8K045 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkn3Q8K045 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkn3Q8K045 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkn3Q8K045 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkn3Q8K045 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkn3Q8K045 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkn3Q8K045 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pkn3Q8K045 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkn3Q8K045 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkn3Q8K045 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkn3Q8K045 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkn3Q8K045 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms