Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV48

ERI1, 3'-5' exoribonuclease 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERI1Q8IV48 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERI1Q8IV48 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERI1Q8IV48 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERI1Q8IV48 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERI1Q8IV48 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERI1Q8IV48 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERI1Q8IV48 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERI1Q8IV48 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERI1Q8IV48 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERI1Q8IV48 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERI1Q8IV48 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERI1Q8IV48 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERI1Q8IV48 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERI1Q8IV48 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERI1Q8IV48 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERI1Q8IV48 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERI1Q8IV48 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERI1Q8IV48 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERI1Q8IV48 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERI1Q8IV48 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERI1Q8IV48 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERI1Q8IV48 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ERI1Q8IV48 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERI1Q8IV48 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERI1Q8IV48 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ERI1Q8IV48 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERI1Q8IV48 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERI1Q8IV48 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERI1Q8IV48 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERI1Q8IV48 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERI1Q8IV48 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERI1Q8IV48 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERI1Q8IV48 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERI1Q8IV48 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERI1Q8IV48 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERI1Q8IV48 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERI1Q8IV48 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERI1Q8IV48 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERI1Q8IV48 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERI1Q8IV48 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERI1Q8IV48 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERI1Q8IV48 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERI1Q8IV48 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERI1Q8IV48 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERI1Q8IV48 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERI1Q8IV48 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERI1Q8IV48 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERI1Q8IV48 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERI1Q8IV48 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERI1Q8IV48 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERI1Q8IV48 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERI1Q8IV48 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERI1Q8IV48 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERI1Q8IV48 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERI1Q8IV48 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ERI1Q8IV48 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERI1Q8IV48 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERI1Q8IV48 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERI1Q8IV48 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERI1Q8IV48 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERI1Q8IV48 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERI1Q8IV48 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERI1Q8IV48 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERI1Q8IV48 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERI1Q8IV48 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERI1Q8IV48 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ERI1Q8IV48 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERI1Q8IV48 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERI1Q8IV48 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERI1Q8IV48 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ERI1Q8IV48 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERI1Q8IV48 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERI1Q8IV48 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERI1Q8IV48 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERI1Q8IV48 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERI1Q8IV48 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERI1Q8IV48 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERI1Q8IV48 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERI1Q8IV48 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERI1Q8IV48 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERI1Q8IV48 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERI1Q8IV48 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERI1Q8IV48 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERI1Q8IV48 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERI1Q8IV48 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERI1Q8IV48 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERI1Q8IV48 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERI1Q8IV48 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERI1Q8IV48 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERI1Q8IV48 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERI1Q8IV48 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERI1Q8IV48 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERI1Q8IV48 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERI1Q8IV48 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERI1Q8IV48 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERI1Q8IV48 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERI1Q8IV48 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERI1Q8IV48 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERI1Q8IV48 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERI1Q8IV48 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms