Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV35

WDR49, WD repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR49Q8IV35 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
WDR49Q8IV35 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
WDR49Q8IV35 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
WDR49Q8IV35 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
WDR49Q8IV35 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
WDR49Q8IV35 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
WDR49Q8IV35 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
WDR49Q8IV35 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
WDR49Q8IV35 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
WDR49Q8IV35 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
WDR49Q8IV35 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
WDR49Q8IV35 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
WDR49Q8IV35 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
WDR49Q8IV35 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
WDR49Q8IV35 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
WDR49Q8IV35 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
WDR49Q8IV35 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
WDR49Q8IV35 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
WDR49Q8IV35 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
WDR49Q8IV35 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
WDR49Q8IV35 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
WDR49Q8IV35 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
WDR49Q8IV35 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
WDR49Q8IV35 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
WDR49Q8IV35 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
WDR49Q8IV35 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
WDR49Q8IV35 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
WDR49Q8IV35 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
WDR49Q8IV35 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
WDR49Q8IV35 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
WDR49Q8IV35 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
WDR49Q8IV35 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
WDR49Q8IV35 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
WDR49Q8IV35 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
WDR49Q8IV35 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
WDR49Q8IV35 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
WDR49Q8IV35 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
WDR49Q8IV35 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
WDR49Q8IV35 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
WDR49Q8IV35 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
WDR49Q8IV35 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
WDR49Q8IV35 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
WDR49Q8IV35 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
WDR49Q8IV35 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
WDR49Q8IV35 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
WDR49Q8IV35 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
WDR49Q8IV35 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
WDR49Q8IV35 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
WDR49Q8IV35 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
WDR49Q8IV35 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
WDR49Q8IV35 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
WDR49Q8IV35 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
WDR49Q8IV35 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
WDR49Q8IV35 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
WDR49Q8IV35 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
WDR49Q8IV35 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
WDR49Q8IV35 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
WDR49Q8IV35 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
WDR49Q8IV35 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
WDR49Q8IV35 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
WDR49Q8IV35 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
WDR49Q8IV35 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
WDR49Q8IV35 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
WDR49Q8IV35 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
WDR49Q8IV35 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
WDR49Q8IV35 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
WDR49Q8IV35 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
WDR49Q8IV35 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
WDR49Q8IV35 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
WDR49Q8IV35 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
WDR49Q8IV35 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
WDR49Q8IV35 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
WDR49Q8IV35 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
WDR49Q8IV35 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
WDR49Q8IV35 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
WDR49Q8IV35 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
WDR49Q8IV35 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
WDR49Q8IV35 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
WDR49Q8IV35 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
WDR49Q8IV35 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
WDR49Q8IV35 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
WDR49Q8IV35 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
WDR49Q8IV35 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
WDR49Q8IV35 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
WDR49Q8IV35 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
WDR49Q8IV35 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
WDR49Q8IV35 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
WDR49Q8IV35 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
WDR49Q8IV35 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
WDR49Q8IV35 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
WDR49Q8IV35 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
WDR49Q8IV35 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
WDR49Q8IV35 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
WDR49Q8IV35 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
WDR49Q8IV35 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
WDR49Q8IV35 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
WDR49Q8IV35 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
WDR49Q8IV35 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
WDR49Q8IV35 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
WDR49Q8IV35 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms