Protein–RNA interactions for Protein: Q8CII8

Syne4, Nesprin-4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne4Q8CII8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Syne4Q8CII8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Syne4Q8CII8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Syne4Q8CII8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Syne4Q8CII8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Syne4Q8CII8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Syne4Q8CII8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Syne4Q8CII8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Syne4Q8CII8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Syne4Q8CII8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Syne4Q8CII8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Syne4Q8CII8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Syne4Q8CII8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Syne4Q8CII8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Syne4Q8CII8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Syne4Q8CII8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syne4Q8CII8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syne4Q8CII8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syne4Q8CII8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syne4Q8CII8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Syne4Q8CII8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Syne4Q8CII8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Syne4Q8CII8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Syne4Q8CII8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Syne4Q8CII8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Syne4Q8CII8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Syne4Q8CII8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Syne4Q8CII8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Syne4Q8CII8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Syne4Q8CII8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Syne4Q8CII8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Syne4Q8CII8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Syne4Q8CII8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Syne4Q8CII8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Syne4Q8CII8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Syne4Q8CII8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Syne4Q8CII8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Syne4Q8CII8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Syne4Q8CII8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syne4Q8CII8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syne4Q8CII8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syne4Q8CII8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syne4Q8CII8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syne4Q8CII8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syne4Q8CII8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Syne4Q8CII8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Syne4Q8CII8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Syne4Q8CII8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Syne4Q8CII8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Syne4Q8CII8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Syne4Q8CII8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Syne4Q8CII8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Syne4Q8CII8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Syne4Q8CII8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Syne4Q8CII8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Syne4Q8CII8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Syne4Q8CII8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Syne4Q8CII8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syne4Q8CII8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Syne4Q8CII8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Syne4Q8CII8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Syne4Q8CII8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Syne4Q8CII8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Syne4Q8CII8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Syne4Q8CII8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Syne4Q8CII8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Syne4Q8CII8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Syne4Q8CII8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Syne4Q8CII8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Syne4Q8CII8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Syne4Q8CII8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Syne4Q8CII8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Syne4Q8CII8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syne4Q8CII8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syne4Q8CII8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syne4Q8CII8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Syne4Q8CII8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Syne4Q8CII8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Syne4Q8CII8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Syne4Q8CII8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Syne4Q8CII8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Syne4Q8CII8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Syne4Q8CII8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Syne4Q8CII8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Syne4Q8CII8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Syne4Q8CII8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Syne4Q8CII8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Syne4Q8CII8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syne4Q8CII8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syne4Q8CII8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syne4Q8CII8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syne4Q8CII8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syne4Q8CII8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syne4Q8CII8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syne4Q8CII8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syne4Q8CII8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syne4Q8CII8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Syne4Q8CII8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Syne4Q8CII8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Syne4Q8CII8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms