Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF7

Tcerg1, Transcription elongation regulator 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcerg1Q8CGF7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tcerg1Q8CGF7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tcerg1Q8CGF7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tcerg1Q8CGF7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tcerg1Q8CGF7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tcerg1Q8CGF7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tcerg1Q8CGF7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tcerg1Q8CGF7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tcerg1Q8CGF7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Tcerg1Q8CGF7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Tcerg1Q8CGF7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Tcerg1Q8CGF7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Tcerg1Q8CGF7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Tcerg1Q8CGF7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tcerg1Q8CGF7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tcerg1Q8CGF7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tcerg1Q8CGF7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tcerg1Q8CGF7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tcerg1Q8CGF7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tcerg1Q8CGF7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tcerg1Q8CGF7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tcerg1Q8CGF7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tcerg1Q8CGF7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tcerg1Q8CGF7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tcerg1Q8CGF7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tcerg1Q8CGF7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tcerg1Q8CGF7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tcerg1Q8CGF7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tcerg1Q8CGF7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tcerg1Q8CGF7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tcerg1Q8CGF7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tcerg1Q8CGF7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tcerg1Q8CGF7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tcerg1Q8CGF7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tcerg1Q8CGF7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tcerg1Q8CGF7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tcerg1Q8CGF7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tcerg1Q8CGF7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tcerg1Q8CGF7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tcerg1Q8CGF7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Tcerg1Q8CGF7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tcerg1Q8CGF7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tcerg1Q8CGF7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tcerg1Q8CGF7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tcerg1Q8CGF7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tcerg1Q8CGF7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tcerg1Q8CGF7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tcerg1Q8CGF7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tcerg1Q8CGF7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tcerg1Q8CGF7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tcerg1Q8CGF7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tcerg1Q8CGF7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tcerg1Q8CGF7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tcerg1Q8CGF7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tcerg1Q8CGF7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tcerg1Q8CGF7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tcerg1Q8CGF7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tcerg1Q8CGF7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tcerg1Q8CGF7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tcerg1Q8CGF7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tcerg1Q8CGF7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tcerg1Q8CGF7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tcerg1Q8CGF7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tcerg1Q8CGF7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tcerg1Q8CGF7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tcerg1Q8CGF7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tcerg1Q8CGF7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tcerg1Q8CGF7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tcerg1Q8CGF7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tcerg1Q8CGF7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tcerg1Q8CGF7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tcerg1Q8CGF7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tcerg1Q8CGF7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tcerg1Q8CGF7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tcerg1Q8CGF7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tcerg1Q8CGF7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tcerg1Q8CGF7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tcerg1Q8CGF7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tcerg1Q8CGF7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tcerg1Q8CGF7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tcerg1Q8CGF7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tcerg1Q8CGF7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tcerg1Q8CGF7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tcerg1Q8CGF7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tcerg1Q8CGF7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tcerg1Q8CGF7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tcerg1Q8CGF7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tcerg1Q8CGF7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tcerg1Q8CGF7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Tcerg1Q8CGF7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tcerg1Q8CGF7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tcerg1Q8CGF7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tcerg1Q8CGF7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tcerg1Q8CGF7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tcerg1Q8CGF7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tcerg1Q8CGF7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tcerg1Q8CGF7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tcerg1Q8CGF7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tcerg1Q8CGF7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tcerg1Q8CGF7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.7 ms