Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDW1

Fam228a, Protein FAM228A, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228aQ8CDW1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam228aQ8CDW1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam228aQ8CDW1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam228aQ8CDW1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam228aQ8CDW1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam228aQ8CDW1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam228aQ8CDW1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam228aQ8CDW1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam228aQ8CDW1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam228aQ8CDW1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam228aQ8CDW1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam228aQ8CDW1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam228aQ8CDW1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam228aQ8CDW1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam228aQ8CDW1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam228aQ8CDW1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam228aQ8CDW1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam228aQ8CDW1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam228aQ8CDW1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam228aQ8CDW1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam228aQ8CDW1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam228aQ8CDW1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam228aQ8CDW1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam228aQ8CDW1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam228aQ8CDW1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam228aQ8CDW1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam228aQ8CDW1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam228aQ8CDW1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam228aQ8CDW1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam228aQ8CDW1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam228aQ8CDW1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam228aQ8CDW1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam228aQ8CDW1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam228aQ8CDW1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam228aQ8CDW1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam228aQ8CDW1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam228aQ8CDW1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam228aQ8CDW1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam228aQ8CDW1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam228aQ8CDW1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam228aQ8CDW1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam228aQ8CDW1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam228aQ8CDW1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam228aQ8CDW1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam228aQ8CDW1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam228aQ8CDW1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam228aQ8CDW1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam228aQ8CDW1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam228aQ8CDW1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam228aQ8CDW1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fam228aQ8CDW1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam228aQ8CDW1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam228aQ8CDW1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam228aQ8CDW1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam228aQ8CDW1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam228aQ8CDW1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam228aQ8CDW1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam228aQ8CDW1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam228aQ8CDW1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam228aQ8CDW1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam228aQ8CDW1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam228aQ8CDW1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam228aQ8CDW1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam228aQ8CDW1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam228aQ8CDW1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam228aQ8CDW1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam228aQ8CDW1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam228aQ8CDW1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam228aQ8CDW1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam228aQ8CDW1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam228aQ8CDW1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam228aQ8CDW1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam228aQ8CDW1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam228aQ8CDW1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam228aQ8CDW1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam228aQ8CDW1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam228aQ8CDW1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam228aQ8CDW1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam228aQ8CDW1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam228aQ8CDW1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam228aQ8CDW1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam228aQ8CDW1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam228aQ8CDW1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam228aQ8CDW1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam228aQ8CDW1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam228aQ8CDW1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam228aQ8CDW1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam228aQ8CDW1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam228aQ8CDW1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam228aQ8CDW1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fam228aQ8CDW1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fam228aQ8CDW1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fam228aQ8CDW1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam228aQ8CDW1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam228aQ8CDW1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam228aQ8CDW1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam228aQ8CDW1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam228aQ8CDW1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam228aQ8CDW1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam228aQ8CDW1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms