Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDR2

Rsph6a, Radial spoke head protein 6 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph6aQ8CDR2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rsph6aQ8CDR2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rsph6aQ8CDR2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rsph6aQ8CDR2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rsph6aQ8CDR2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Rsph6aQ8CDR2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rsph6aQ8CDR2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rsph6aQ8CDR2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rsph6aQ8CDR2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rsph6aQ8CDR2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Rsph6aQ8CDR2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rsph6aQ8CDR2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rsph6aQ8CDR2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rsph6aQ8CDR2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rsph6aQ8CDR2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rsph6aQ8CDR2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rsph6aQ8CDR2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rsph6aQ8CDR2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rsph6aQ8CDR2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rsph6aQ8CDR2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rsph6aQ8CDR2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Rsph6aQ8CDR2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rsph6aQ8CDR2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rsph6aQ8CDR2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rsph6aQ8CDR2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rsph6aQ8CDR2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rsph6aQ8CDR2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Rsph6aQ8CDR2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rsph6aQ8CDR2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rsph6aQ8CDR2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rsph6aQ8CDR2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rsph6aQ8CDR2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rsph6aQ8CDR2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rsph6aQ8CDR2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rsph6aQ8CDR2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rsph6aQ8CDR2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rsph6aQ8CDR2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rsph6aQ8CDR2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rsph6aQ8CDR2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rsph6aQ8CDR2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rsph6aQ8CDR2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rsph6aQ8CDR2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rsph6aQ8CDR2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rsph6aQ8CDR2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rsph6aQ8CDR2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rsph6aQ8CDR2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rsph6aQ8CDR2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Rsph6aQ8CDR2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Rsph6aQ8CDR2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rsph6aQ8CDR2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rsph6aQ8CDR2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rsph6aQ8CDR2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rsph6aQ8CDR2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rsph6aQ8CDR2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rsph6aQ8CDR2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rsph6aQ8CDR2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rsph6aQ8CDR2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rsph6aQ8CDR2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rsph6aQ8CDR2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rsph6aQ8CDR2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rsph6aQ8CDR2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rsph6aQ8CDR2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rsph6aQ8CDR2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rsph6aQ8CDR2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Rsph6aQ8CDR2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rsph6aQ8CDR2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rsph6aQ8CDR2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rsph6aQ8CDR2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rsph6aQ8CDR2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rsph6aQ8CDR2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rsph6aQ8CDR2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rsph6aQ8CDR2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rsph6aQ8CDR2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rsph6aQ8CDR2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rsph6aQ8CDR2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Rsph6aQ8CDR2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rsph6aQ8CDR2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rsph6aQ8CDR2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rsph6aQ8CDR2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rsph6aQ8CDR2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rsph6aQ8CDR2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rsph6aQ8CDR2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rsph6aQ8CDR2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Rsph6aQ8CDR2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rsph6aQ8CDR2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rsph6aQ8CDR2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rsph6aQ8CDR2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rsph6aQ8CDR2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rsph6aQ8CDR2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rsph6aQ8CDR2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rsph6aQ8CDR2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rsph6aQ8CDR2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rsph6aQ8CDR2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rsph6aQ8CDR2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Rsph6aQ8CDR2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rsph6aQ8CDR2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rsph6aQ8CDR2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rsph6aQ8CDR2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rsph6aQ8CDR2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rsph6aQ8CDR2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms