Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc38Q8CDN8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc38Q8CDN8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc38Q8CDN8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc38Q8CDN8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc38Q8CDN8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc38Q8CDN8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc38Q8CDN8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc38Q8CDN8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc38Q8CDN8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc38Q8CDN8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc38Q8CDN8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc38Q8CDN8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc38Q8CDN8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc38Q8CDN8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc38Q8CDN8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc38Q8CDN8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc38Q8CDN8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc38Q8CDN8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc38Q8CDN8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc38Q8CDN8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc38Q8CDN8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc38Q8CDN8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc38Q8CDN8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc38Q8CDN8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc38Q8CDN8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc38Q8CDN8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc38Q8CDN8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc38Q8CDN8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc38Q8CDN8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc38Q8CDN8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc38Q8CDN8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc38Q8CDN8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc38Q8CDN8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc38Q8CDN8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc38Q8CDN8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc38Q8CDN8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc38Q8CDN8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc38Q8CDN8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc38Q8CDN8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc38Q8CDN8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc38Q8CDN8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc38Q8CDN8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc38Q8CDN8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc38Q8CDN8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc38Q8CDN8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc38Q8CDN8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc38Q8CDN8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc38Q8CDN8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc38Q8CDN8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc38Q8CDN8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc38Q8CDN8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc38Q8CDN8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc38Q8CDN8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc38Q8CDN8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc38Q8CDN8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc38Q8CDN8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc38Q8CDN8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc38Q8CDN8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc38Q8CDN8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc38Q8CDN8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc38Q8CDN8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc38Q8CDN8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc38Q8CDN8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc38Q8CDN8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc38Q8CDN8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc38Q8CDN8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc38Q8CDN8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc38Q8CDN8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc38Q8CDN8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc38Q8CDN8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc38Q8CDN8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc38Q8CDN8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc38Q8CDN8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc38Q8CDN8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc38Q8CDN8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc38Q8CDN8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc38Q8CDN8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc38Q8CDN8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc38Q8CDN8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc38Q8CDN8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc38Q8CDN8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc38Q8CDN8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc38Q8CDN8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc38Q8CDN8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc38Q8CDN8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc38Q8CDN8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc38Q8CDN8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc38Q8CDN8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc38Q8CDN8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc38Q8CDN8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc38Q8CDN8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc38Q8CDN8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc38Q8CDN8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc38Q8CDN8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc38Q8CDN8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc38Q8CDN8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc38Q8CDN8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc38Q8CDN8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc38Q8CDN8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms