Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC21

Ttc19, Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc19Q8CC21 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ttc19Q8CC21 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ttc19Q8CC21 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ttc19Q8CC21 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Ttc19Q8CC21 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Ttc19Q8CC21 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ttc19Q8CC21 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
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Ttc19Q8CC21 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
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Ttc19Q8CC21 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
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Ttc19Q8CC21 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
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Ttc19Q8CC21 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ttc19Q8CC21 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ttc19Q8CC21 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
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Ttc19Q8CC21 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ttc19Q8CC21 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ttc19Q8CC21 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ttc19Q8CC21 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
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Ttc19Q8CC21 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
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Ttc19Q8CC21 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ttc19Q8CC21 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
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Ttc19Q8CC21 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
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Ttc19Q8CC21 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ttc19Q8CC21 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ttc19Q8CC21 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ttc19Q8CC21 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Ttc19Q8CC21 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ttc19Q8CC21 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Ttc19Q8CC21 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ttc19Q8CC21 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ttc19Q8CC21 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ttc19Q8CC21 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ttc19Q8CC21 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ttc19Q8CC21 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ttc19Q8CC21 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ttc19Q8CC21 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ttc19Q8CC21 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ttc19Q8CC21 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ttc19Q8CC21 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ttc19Q8CC21 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ttc19Q8CC21 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ttc19Q8CC21 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ttc19Q8CC21 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ttc19Q8CC21 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ttc19Q8CC21 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ttc19Q8CC21 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ttc19Q8CC21 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ttc19Q8CC21 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ttc19Q8CC21 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ttc19Q8CC21 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ttc19Q8CC21 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ttc19Q8CC21 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ttc19Q8CC21 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ttc19Q8CC21 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1050.2 ms