Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Y1

Tgif2, Homeobox protein TGIF2, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif2Q8C0Y1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tgif2Q8C0Y1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tgif2Q8C0Y1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tgif2Q8C0Y1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tgif2Q8C0Y1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tgif2Q8C0Y1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgif2Q8C0Y1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgif2Q8C0Y1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgif2Q8C0Y1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgif2Q8C0Y1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgif2Q8C0Y1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgif2Q8C0Y1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgif2Q8C0Y1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgif2Q8C0Y1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgif2Q8C0Y1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgif2Q8C0Y1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgif2Q8C0Y1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgif2Q8C0Y1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgif2Q8C0Y1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgif2Q8C0Y1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tgif2Q8C0Y1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tgif2Q8C0Y1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tgif2Q8C0Y1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tgif2Q8C0Y1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tgif2Q8C0Y1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tgif2Q8C0Y1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tgif2Q8C0Y1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tgif2Q8C0Y1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tgif2Q8C0Y1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tgif2Q8C0Y1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tgif2Q8C0Y1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tgif2Q8C0Y1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tgif2Q8C0Y1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tgif2Q8C0Y1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tgif2Q8C0Y1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tgif2Q8C0Y1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tgif2Q8C0Y1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tgif2Q8C0Y1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tgif2Q8C0Y1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tgif2Q8C0Y1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tgif2Q8C0Y1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tgif2Q8C0Y1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tgif2Q8C0Y1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tgif2Q8C0Y1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tgif2Q8C0Y1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tgif2Q8C0Y1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tgif2Q8C0Y1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tgif2Q8C0Y1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tgif2Q8C0Y1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tgif2Q8C0Y1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tgif2Q8C0Y1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgif2Q8C0Y1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgif2Q8C0Y1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgif2Q8C0Y1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgif2Q8C0Y1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgif2Q8C0Y1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgif2Q8C0Y1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgif2Q8C0Y1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgif2Q8C0Y1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgif2Q8C0Y1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgif2Q8C0Y1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tgif2Q8C0Y1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tgif2Q8C0Y1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tgif2Q8C0Y1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tgif2Q8C0Y1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tgif2Q8C0Y1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tgif2Q8C0Y1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tgif2Q8C0Y1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tgif2Q8C0Y1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tgif2Q8C0Y1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tgif2Q8C0Y1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tgif2Q8C0Y1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tgif2Q8C0Y1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tgif2Q8C0Y1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tgif2Q8C0Y1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tgif2Q8C0Y1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tgif2Q8C0Y1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tgif2Q8C0Y1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tgif2Q8C0Y1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tgif2Q8C0Y1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tgif2Q8C0Y1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tgif2Q8C0Y1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tgif2Q8C0Y1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tgif2Q8C0Y1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tgif2Q8C0Y1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tgif2Q8C0Y1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tgif2Q8C0Y1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tgif2Q8C0Y1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tgif2Q8C0Y1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tgif2Q8C0Y1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tgif2Q8C0Y1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tgif2Q8C0Y1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tgif2Q8C0Y1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tgif2Q8C0Y1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tgif2Q8C0Y1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tgif2Q8C0Y1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tgif2Q8C0Y1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tgif2Q8C0Y1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tgif2Q8C0Y1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tgif2Q8C0Y1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms