Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q9

Rapgef5, Rap guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef5Q8C0Q9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rapgef5Q8C0Q9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rapgef5Q8C0Q9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rapgef5Q8C0Q9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rapgef5Q8C0Q9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rapgef5Q8C0Q9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rapgef5Q8C0Q9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rapgef5Q8C0Q9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rapgef5Q8C0Q9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rapgef5Q8C0Q9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rapgef5Q8C0Q9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rapgef5Q8C0Q9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rapgef5Q8C0Q9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rapgef5Q8C0Q9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rapgef5Q8C0Q9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rapgef5Q8C0Q9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rapgef5Q8C0Q9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rapgef5Q8C0Q9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rapgef5Q8C0Q9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rapgef5Q8C0Q9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Rapgef5Q8C0Q9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rapgef5Q8C0Q9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rapgef5Q8C0Q9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rapgef5Q8C0Q9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rapgef5Q8C0Q9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Rapgef5Q8C0Q9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rapgef5Q8C0Q9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rapgef5Q8C0Q9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rapgef5Q8C0Q9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rapgef5Q8C0Q9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rapgef5Q8C0Q9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rapgef5Q8C0Q9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rapgef5Q8C0Q9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rapgef5Q8C0Q9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rapgef5Q8C0Q9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rapgef5Q8C0Q9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rapgef5Q8C0Q9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rapgef5Q8C0Q9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rapgef5Q8C0Q9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rapgef5Q8C0Q9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rapgef5Q8C0Q9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rapgef5Q8C0Q9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rapgef5Q8C0Q9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rapgef5Q8C0Q9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rapgef5Q8C0Q9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rapgef5Q8C0Q9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rapgef5Q8C0Q9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rapgef5Q8C0Q9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rapgef5Q8C0Q9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rapgef5Q8C0Q9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rapgef5Q8C0Q9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Rapgef5Q8C0Q9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rapgef5Q8C0Q9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rapgef5Q8C0Q9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rapgef5Q8C0Q9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rapgef5Q8C0Q9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rapgef5Q8C0Q9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rapgef5Q8C0Q9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rapgef5Q8C0Q9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rapgef5Q8C0Q9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rapgef5Q8C0Q9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rapgef5Q8C0Q9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rapgef5Q8C0Q9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rapgef5Q8C0Q9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rapgef5Q8C0Q9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rapgef5Q8C0Q9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rapgef5Q8C0Q9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rapgef5Q8C0Q9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rapgef5Q8C0Q9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rapgef5Q8C0Q9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rapgef5Q8C0Q9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rapgef5Q8C0Q9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rapgef5Q8C0Q9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rapgef5Q8C0Q9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rapgef5Q8C0Q9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rapgef5Q8C0Q9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rapgef5Q8C0Q9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rapgef5Q8C0Q9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rapgef5Q8C0Q9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rapgef5Q8C0Q9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rapgef5Q8C0Q9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rapgef5Q8C0Q9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rapgef5Q8C0Q9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rapgef5Q8C0Q9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rapgef5Q8C0Q9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rapgef5Q8C0Q9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rapgef5Q8C0Q9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rapgef5Q8C0Q9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rapgef5Q8C0Q9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rapgef5Q8C0Q9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rapgef5Q8C0Q9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rapgef5Q8C0Q9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rapgef5Q8C0Q9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rapgef5Q8C0Q9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rapgef5Q8C0Q9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rapgef5Q8C0Q9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rapgef5Q8C0Q9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rapgef5Q8C0Q9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rapgef5Q8C0Q9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rapgef5Q8C0Q9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
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