Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZ81

Lrrtm3, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 3, mousemouse

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm3Q8BZ81 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrtm3Q8BZ81 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrtm3Q8BZ81 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrtm3Q8BZ81 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrtm3Q8BZ81 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrtm3Q8BZ81 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrtm3Q8BZ81 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrtm3Q8BZ81 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrtm3Q8BZ81 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrtm3Q8BZ81 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrtm3Q8BZ81 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrtm3Q8BZ81 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrtm3Q8BZ81 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrtm3Q8BZ81 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrtm3Q8BZ81 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrtm3Q8BZ81 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrtm3Q8BZ81 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrtm3Q8BZ81 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrtm3Q8BZ81 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrtm3Q8BZ81 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Lrrtm3Q8BZ81 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Lrrtm3Q8BZ81 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrtm3Q8BZ81 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrtm3Q8BZ81 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrtm3Q8BZ81 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrtm3Q8BZ81 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrtm3Q8BZ81 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrtm3Q8BZ81 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrtm3Q8BZ81 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrtm3Q8BZ81 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrtm3Q8BZ81 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrtm3Q8BZ81 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrtm3Q8BZ81 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrtm3Q8BZ81 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrtm3Q8BZ81 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrtm3Q8BZ81 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrtm3Q8BZ81 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrtm3Q8BZ81 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrtm3Q8BZ81 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrtm3Q8BZ81 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrtm3Q8BZ81 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrtm3Q8BZ81 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrtm3Q8BZ81 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrtm3Q8BZ81 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrtm3Q8BZ81 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrtm3Q8BZ81 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrtm3Q8BZ81 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrtm3Q8BZ81 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrtm3Q8BZ81 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrtm3Q8BZ81 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrtm3Q8BZ81 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrtm3Q8BZ81 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrtm3Q8BZ81 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrtm3Q8BZ81 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrtm3Q8BZ81 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrtm3Q8BZ81 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrtm3Q8BZ81 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrtm3Q8BZ81 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrtm3Q8BZ81 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lrrtm3Q8BZ81 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lrrtm3Q8BZ81 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrtm3Q8BZ81 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrtm3Q8BZ81 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrtm3Q8BZ81 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrtm3Q8BZ81 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrtm3Q8BZ81 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrtm3Q8BZ81 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrtm3Q8BZ81 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrtm3Q8BZ81 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrtm3Q8BZ81 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrtm3Q8BZ81 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrtm3Q8BZ81 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrtm3Q8BZ81 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrtm3Q8BZ81 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrtm3Q8BZ81 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrtm3Q8BZ81 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrtm3Q8BZ81 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrtm3Q8BZ81 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrtm3Q8BZ81 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrtm3Q8BZ81 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrtm3Q8BZ81 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrtm3Q8BZ81 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrtm3Q8BZ81 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrtm3Q8BZ81 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrtm3Q8BZ81 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrtm3Q8BZ81 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrtm3Q8BZ81 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrtm3Q8BZ81 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrtm3Q8BZ81 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrtm3Q8BZ81 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrtm3Q8BZ81 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrtm3Q8BZ81 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrtm3Q8BZ81 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrtm3Q8BZ81 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrtm3Q8BZ81 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrtm3Q8BZ81 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrtm3Q8BZ81 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrtm3Q8BZ81 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrtm3Q8BZ81 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrtm3Q8BZ81 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms