Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX90

Fndc3a, Fibronectin type-III domain-containing protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3aQ8BX90 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fndc3aQ8BX90 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fndc3aQ8BX90 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fndc3aQ8BX90 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fndc3aQ8BX90 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fndc3aQ8BX90 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fndc3aQ8BX90 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fndc3aQ8BX90 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fndc3aQ8BX90 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Fndc3aQ8BX90 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fndc3aQ8BX90 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fndc3aQ8BX90 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fndc3aQ8BX90 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fndc3aQ8BX90 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fndc3aQ8BX90 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc3aQ8BX90 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc3aQ8BX90 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc3aQ8BX90 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc3aQ8BX90 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc3aQ8BX90 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc3aQ8BX90 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc3aQ8BX90 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc3aQ8BX90 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fndc3aQ8BX90 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fndc3aQ8BX90 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fndc3aQ8BX90 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fndc3aQ8BX90 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fndc3aQ8BX90 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fndc3aQ8BX90 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fndc3aQ8BX90 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fndc3aQ8BX90 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fndc3aQ8BX90 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fndc3aQ8BX90 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fndc3aQ8BX90 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fndc3aQ8BX90 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fndc3aQ8BX90 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fndc3aQ8BX90 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Fndc3aQ8BX90 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fndc3aQ8BX90 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fndc3aQ8BX90 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fndc3aQ8BX90 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fndc3aQ8BX90 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fndc3aQ8BX90 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fndc3aQ8BX90 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Fndc3aQ8BX90 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Fndc3aQ8BX90 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fndc3aQ8BX90 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fndc3aQ8BX90 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fndc3aQ8BX90 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fndc3aQ8BX90 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fndc3aQ8BX90 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fndc3aQ8BX90 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fndc3aQ8BX90 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fndc3aQ8BX90 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fndc3aQ8BX90 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fndc3aQ8BX90 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fndc3aQ8BX90 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fndc3aQ8BX90 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fndc3aQ8BX90 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fndc3aQ8BX90 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fndc3aQ8BX90 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fndc3aQ8BX90 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fndc3aQ8BX90 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fndc3aQ8BX90 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fndc3aQ8BX90 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fndc3aQ8BX90 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fndc3aQ8BX90 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Fndc3aQ8BX90 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fndc3aQ8BX90 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fndc3aQ8BX90 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fndc3aQ8BX90 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fndc3aQ8BX90 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fndc3aQ8BX90 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fndc3aQ8BX90 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fndc3aQ8BX90 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fndc3aQ8BX90 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fndc3aQ8BX90 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fndc3aQ8BX90 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fndc3aQ8BX90 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fndc3aQ8BX90 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fndc3aQ8BX90 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fndc3aQ8BX90 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fndc3aQ8BX90 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fndc3aQ8BX90 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fndc3aQ8BX90 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fndc3aQ8BX90 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fndc3aQ8BX90 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fndc3aQ8BX90 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fndc3aQ8BX90 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fndc3aQ8BX90 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fndc3aQ8BX90 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fndc3aQ8BX90 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fndc3aQ8BX90 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fndc3aQ8BX90 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Fndc3aQ8BX90 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fndc3aQ8BX90 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fndc3aQ8BX90 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fndc3aQ8BX90 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fndc3aQ8BX90 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fndc3aQ8BX90 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms