Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup54Q8BTS4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup54Q8BTS4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup54Q8BTS4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup54Q8BTS4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup54Q8BTS4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup54Q8BTS4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup54Q8BTS4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup54Q8BTS4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup54Q8BTS4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup54Q8BTS4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup54Q8BTS4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup54Q8BTS4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup54Q8BTS4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nup54Q8BTS4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup54Q8BTS4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup54Q8BTS4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup54Q8BTS4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup54Q8BTS4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup54Q8BTS4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup54Q8BTS4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup54Q8BTS4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup54Q8BTS4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup54Q8BTS4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup54Q8BTS4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup54Q8BTS4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup54Q8BTS4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup54Q8BTS4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup54Q8BTS4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup54Q8BTS4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup54Q8BTS4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup54Q8BTS4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup54Q8BTS4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup54Q8BTS4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup54Q8BTS4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup54Q8BTS4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup54Q8BTS4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup54Q8BTS4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup54Q8BTS4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup54Q8BTS4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup54Q8BTS4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup54Q8BTS4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup54Q8BTS4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup54Q8BTS4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup54Q8BTS4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup54Q8BTS4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup54Q8BTS4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup54Q8BTS4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup54Q8BTS4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup54Q8BTS4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup54Q8BTS4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup54Q8BTS4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup54Q8BTS4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup54Q8BTS4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup54Q8BTS4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup54Q8BTS4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup54Q8BTS4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup54Q8BTS4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup54Q8BTS4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup54Q8BTS4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup54Q8BTS4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup54Q8BTS4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup54Q8BTS4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup54Q8BTS4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup54Q8BTS4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup54Q8BTS4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup54Q8BTS4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup54Q8BTS4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup54Q8BTS4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup54Q8BTS4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup54Q8BTS4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup54Q8BTS4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup54Q8BTS4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup54Q8BTS4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup54Q8BTS4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup54Q8BTS4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nup54Q8BTS4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nup54Q8BTS4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nup54Q8BTS4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nup54Q8BTS4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nup54Q8BTS4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nup54Q8BTS4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nup54Q8BTS4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nup54Q8BTS4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nup54Q8BTS4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nup54Q8BTS4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nup54Q8BTS4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nup54Q8BTS4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nup54Q8BTS4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup54Q8BTS4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup54Q8BTS4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup54Q8BTS4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup54Q8BTS4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup54Q8BTS4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup54Q8BTS4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup54Q8BTS4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup54Q8BTS4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup54Q8BTS4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup54Q8BTS4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup54Q8BTS4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms