Protein–RNA interactions for Protein: Q8BNV1

Trmt2a, tRNA (uracil-5-)-methyltransferase homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt2aQ8BNV1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trmt2aQ8BNV1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trmt2aQ8BNV1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trmt2aQ8BNV1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Trmt2aQ8BNV1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trmt2aQ8BNV1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trmt2aQ8BNV1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trmt2aQ8BNV1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trmt2aQ8BNV1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trmt2aQ8BNV1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Trmt2aQ8BNV1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trmt2aQ8BNV1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trmt2aQ8BNV1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trmt2aQ8BNV1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trmt2aQ8BNV1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trmt2aQ8BNV1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trmt2aQ8BNV1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trmt2aQ8BNV1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trmt2aQ8BNV1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trmt2aQ8BNV1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trmt2aQ8BNV1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trmt2aQ8BNV1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Trmt2aQ8BNV1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trmt2aQ8BNV1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trmt2aQ8BNV1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trmt2aQ8BNV1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.72
Trmt2aQ8BNV1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trmt2aQ8BNV1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trmt2aQ8BNV1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trmt2aQ8BNV1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trmt2aQ8BNV1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trmt2aQ8BNV1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trmt2aQ8BNV1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trmt2aQ8BNV1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trmt2aQ8BNV1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trmt2aQ8BNV1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trmt2aQ8BNV1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trmt2aQ8BNV1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trmt2aQ8BNV1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trmt2aQ8BNV1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trmt2aQ8BNV1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trmt2aQ8BNV1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trmt2aQ8BNV1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trmt2aQ8BNV1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Trmt2aQ8BNV1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trmt2aQ8BNV1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trmt2aQ8BNV1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trmt2aQ8BNV1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Trmt2aQ8BNV1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trmt2aQ8BNV1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trmt2aQ8BNV1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trmt2aQ8BNV1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Trmt2aQ8BNV1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trmt2aQ8BNV1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trmt2aQ8BNV1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trmt2aQ8BNV1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trmt2aQ8BNV1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trmt2aQ8BNV1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trmt2aQ8BNV1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Trmt2aQ8BNV1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Trmt2aQ8BNV1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trmt2aQ8BNV1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trmt2aQ8BNV1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trmt2aQ8BNV1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trmt2aQ8BNV1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trmt2aQ8BNV1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trmt2aQ8BNV1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trmt2aQ8BNV1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trmt2aQ8BNV1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trmt2aQ8BNV1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trmt2aQ8BNV1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Trmt2aQ8BNV1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trmt2aQ8BNV1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trmt2aQ8BNV1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trmt2aQ8BNV1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trmt2aQ8BNV1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trmt2aQ8BNV1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trmt2aQ8BNV1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trmt2aQ8BNV1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trmt2aQ8BNV1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trmt2aQ8BNV1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trmt2aQ8BNV1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trmt2aQ8BNV1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trmt2aQ8BNV1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trmt2aQ8BNV1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trmt2aQ8BNV1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trmt2aQ8BNV1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trmt2aQ8BNV1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trmt2aQ8BNV1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Trmt2aQ8BNV1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trmt2aQ8BNV1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trmt2aQ8BNV1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trmt2aQ8BNV1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trmt2aQ8BNV1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trmt2aQ8BNV1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trmt2aQ8BNV1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trmt2aQ8BNV1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trmt2aQ8BNV1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trmt2aQ8BNV1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trmt2aQ8BNV1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms