Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Grik4Q8BMF5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Grik4Q8BMF5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Grik4Q8BMF5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Grik4Q8BMF5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Grik4Q8BMF5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Grik4Q8BMF5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Grik4Q8BMF5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Grik4Q8BMF5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Grik4Q8BMF5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Grik4Q8BMF5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Grik4Q8BMF5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Grik4Q8BMF5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Grik4Q8BMF5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Grik4Q8BMF5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Grik4Q8BMF5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Grik4Q8BMF5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Grik4Q8BMF5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Grik4Q8BMF5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Grik4Q8BMF5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Grik4Q8BMF5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Grik4Q8BMF5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Grik4Q8BMF5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Grik4Q8BMF5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Grik4Q8BMF5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Grik4Q8BMF5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Grik4Q8BMF5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Grik4Q8BMF5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Grik4Q8BMF5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Grik4Q8BMF5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Grik4Q8BMF5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Grik4Q8BMF5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Grik4Q8BMF5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Grik4Q8BMF5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Grik4Q8BMF5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Grik4Q8BMF5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Grik4Q8BMF5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Grik4Q8BMF5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Grik4Q8BMF5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Grik4Q8BMF5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Grik4Q8BMF5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Grik4Q8BMF5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Grik4Q8BMF5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Grik4Q8BMF5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Grik4Q8BMF5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Grik4Q8BMF5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Grik4Q8BMF5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Grik4Q8BMF5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Grik4Q8BMF5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Grik4Q8BMF5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Grik4Q8BMF5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Grik4Q8BMF5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Grik4Q8BMF5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Grik4Q8BMF5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Grik4Q8BMF5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Grik4Q8BMF5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Grik4Q8BMF5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Grik4Q8BMF5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Grik4Q8BMF5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Grik4Q8BMF5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Grik4Q8BMF5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Grik4Q8BMF5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Grik4Q8BMF5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Grik4Q8BMF5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Grik4Q8BMF5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Grik4Q8BMF5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Grik4Q8BMF5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grik4Q8BMF5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grik4Q8BMF5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grik4Q8BMF5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grik4Q8BMF5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grik4Q8BMF5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grik4Q8BMF5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grik4Q8BMF5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grik4Q8BMF5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Grik4Q8BMF5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Grik4Q8BMF5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Grik4Q8BMF5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Grik4Q8BMF5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Grik4Q8BMF5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Grik4Q8BMF5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Grik4Q8BMF5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Grik4Q8BMF5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Grik4Q8BMF5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Grik4Q8BMF5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Grik4Q8BMF5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Grik4Q8BMF5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Grik4Q8BMF5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Grik4Q8BMF5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Grik4Q8BMF5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Grik4Q8BMF5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Grik4Q8BMF5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Grik4Q8BMF5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Grik4Q8BMF5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Grik4Q8BMF5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Grik4Q8BMF5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Grik4Q8BMF5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Grik4Q8BMF5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Grik4Q8BMF5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Grik4Q8BMF5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms