Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG18

Necab1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab1Q8BG18 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Necab1Q8BG18 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Necab1Q8BG18 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Necab1Q8BG18 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Necab1Q8BG18 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Necab1Q8BG18 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Necab1Q8BG18 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Necab1Q8BG18 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Necab1Q8BG18 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Necab1Q8BG18 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Necab1Q8BG18 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Necab1Q8BG18 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Necab1Q8BG18 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Necab1Q8BG18 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Necab1Q8BG18 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Necab1Q8BG18 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Necab1Q8BG18 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Necab1Q8BG18 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Necab1Q8BG18 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Necab1Q8BG18 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Necab1Q8BG18 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Necab1Q8BG18 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Necab1Q8BG18 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Necab1Q8BG18 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Necab1Q8BG18 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Necab1Q8BG18 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Necab1Q8BG18 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Necab1Q8BG18 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Necab1Q8BG18 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Necab1Q8BG18 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Necab1Q8BG18 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Necab1Q8BG18 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Necab1Q8BG18 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Necab1Q8BG18 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Necab1Q8BG18 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Necab1Q8BG18 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Necab1Q8BG18 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Necab1Q8BG18 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Necab1Q8BG18 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Necab1Q8BG18 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Necab1Q8BG18 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Necab1Q8BG18 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Necab1Q8BG18 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Necab1Q8BG18 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Necab1Q8BG18 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Necab1Q8BG18 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Necab1Q8BG18 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Necab1Q8BG18 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Necab1Q8BG18 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Necab1Q8BG18 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Necab1Q8BG18 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Necab1Q8BG18 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Necab1Q8BG18 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Necab1Q8BG18 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Necab1Q8BG18 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Necab1Q8BG18 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Necab1Q8BG18 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Necab1Q8BG18 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Necab1Q8BG18 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Necab1Q8BG18 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Necab1Q8BG18 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Necab1Q8BG18 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Necab1Q8BG18 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Necab1Q8BG18 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Necab1Q8BG18 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Necab1Q8BG18 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Necab1Q8BG18 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Necab1Q8BG18 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Necab1Q8BG18 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Necab1Q8BG18 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Necab1Q8BG18 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Necab1Q8BG18 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Necab1Q8BG18 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Necab1Q8BG18 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Necab1Q8BG18 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Necab1Q8BG18 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Necab1Q8BG18 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Necab1Q8BG18 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Necab1Q8BG18 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Necab1Q8BG18 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Necab1Q8BG18 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Necab1Q8BG18 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Necab1Q8BG18 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Necab1Q8BG18 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Necab1Q8BG18 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Necab1Q8BG18 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Necab1Q8BG18 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Necab1Q8BG18 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Necab1Q8BG18 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Necab1Q8BG18 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Necab1Q8BG18 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Necab1Q8BG18 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Necab1Q8BG18 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Necab1Q8BG18 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Necab1Q8BG18 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Necab1Q8BG18 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Necab1Q8BG18 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Necab1Q8BG18 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Necab1Q8BG18 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Necab1Q8BG18 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.6 ms