Protein–RNA interactions for Protein: Q86YW5

TREML1, Trem-like transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML1Q86YW5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TREML1Q86YW5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TREML1Q86YW5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TREML1Q86YW5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TREML1Q86YW5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TREML1Q86YW5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TREML1Q86YW5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TREML1Q86YW5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TREML1Q86YW5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TREML1Q86YW5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TREML1Q86YW5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TREML1Q86YW5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TREML1Q86YW5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TREML1Q86YW5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TREML1Q86YW5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TREML1Q86YW5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
TREML1Q86YW5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TREML1Q86YW5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TREML1Q86YW5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TREML1Q86YW5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TREML1Q86YW5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TREML1Q86YW5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TREML1Q86YW5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TREML1Q86YW5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TREML1Q86YW5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TREML1Q86YW5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TREML1Q86YW5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TREML1Q86YW5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TREML1Q86YW5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TREML1Q86YW5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TREML1Q86YW5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TREML1Q86YW5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TREML1Q86YW5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TREML1Q86YW5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TREML1Q86YW5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TREML1Q86YW5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TREML1Q86YW5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TREML1Q86YW5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TREML1Q86YW5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TREML1Q86YW5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TREML1Q86YW5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TREML1Q86YW5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TREML1Q86YW5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TREML1Q86YW5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TREML1Q86YW5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TREML1Q86YW5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TREML1Q86YW5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TREML1Q86YW5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TREML1Q86YW5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TREML1Q86YW5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TREML1Q86YW5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TREML1Q86YW5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TREML1Q86YW5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TREML1Q86YW5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TREML1Q86YW5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TREML1Q86YW5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TREML1Q86YW5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TREML1Q86YW5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TREML1Q86YW5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TREML1Q86YW5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TREML1Q86YW5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TREML1Q86YW5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TREML1Q86YW5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TREML1Q86YW5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TREML1Q86YW5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TREML1Q86YW5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TREML1Q86YW5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TREML1Q86YW5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TREML1Q86YW5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TREML1Q86YW5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TREML1Q86YW5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TREML1Q86YW5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TREML1Q86YW5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TREML1Q86YW5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TREML1Q86YW5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TREML1Q86YW5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TREML1Q86YW5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TREML1Q86YW5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TREML1Q86YW5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TREML1Q86YW5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TREML1Q86YW5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TREML1Q86YW5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TREML1Q86YW5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TREML1Q86YW5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TREML1Q86YW5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TREML1Q86YW5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TREML1Q86YW5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TREML1Q86YW5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TREML1Q86YW5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TREML1Q86YW5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TREML1Q86YW5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TREML1Q86YW5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TREML1Q86YW5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TREML1Q86YW5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TREML1Q86YW5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TREML1Q86YW5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TREML1Q86YW5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TREML1Q86YW5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TREML1Q86YW5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TREML1Q86YW5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms