Protein–RNA interactions for Protein: Q86VR2

RETREG3, Reticulophagy regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG3Q86VR2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RETREG3Q86VR2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RETREG3Q86VR2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RETREG3Q86VR2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RETREG3Q86VR2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RETREG3Q86VR2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RETREG3Q86VR2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RETREG3Q86VR2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RETREG3Q86VR2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RETREG3Q86VR2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RETREG3Q86VR2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RETREG3Q86VR2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RETREG3Q86VR2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RETREG3Q86VR2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RETREG3Q86VR2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RETREG3Q86VR2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RETREG3Q86VR2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RETREG3Q86VR2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RETREG3Q86VR2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RETREG3Q86VR2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RETREG3Q86VR2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RETREG3Q86VR2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RETREG3Q86VR2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RETREG3Q86VR2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RETREG3Q86VR2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RETREG3Q86VR2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RETREG3Q86VR2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RETREG3Q86VR2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RETREG3Q86VR2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RETREG3Q86VR2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RETREG3Q86VR2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RETREG3Q86VR2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RETREG3Q86VR2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RETREG3Q86VR2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RETREG3Q86VR2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RETREG3Q86VR2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RETREG3Q86VR2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RETREG3Q86VR2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RETREG3Q86VR2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RETREG3Q86VR2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RETREG3Q86VR2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RETREG3Q86VR2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RETREG3Q86VR2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RETREG3Q86VR2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RETREG3Q86VR2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RETREG3Q86VR2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RETREG3Q86VR2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RETREG3Q86VR2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RETREG3Q86VR2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RETREG3Q86VR2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RETREG3Q86VR2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RETREG3Q86VR2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RETREG3Q86VR2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RETREG3Q86VR2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RETREG3Q86VR2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RETREG3Q86VR2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RETREG3Q86VR2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RETREG3Q86VR2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RETREG3Q86VR2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RETREG3Q86VR2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RETREG3Q86VR2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RETREG3Q86VR2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RETREG3Q86VR2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RETREG3Q86VR2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RETREG3Q86VR2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RETREG3Q86VR2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RETREG3Q86VR2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RETREG3Q86VR2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RETREG3Q86VR2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RETREG3Q86VR2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RETREG3Q86VR2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RETREG3Q86VR2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RETREG3Q86VR2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RETREG3Q86VR2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RETREG3Q86VR2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RETREG3Q86VR2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RETREG3Q86VR2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RETREG3Q86VR2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RETREG3Q86VR2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms