Protein–RNA interactions for Protein: Q86UR5

RIMS1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS1Q86UR5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
RIMS1Q86UR5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
RIMS1Q86UR5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
RIMS1Q86UR5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
RIMS1Q86UR5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
RIMS1Q86UR5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
RIMS1Q86UR5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
RIMS1Q86UR5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
RIMS1Q86UR5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
RIMS1Q86UR5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
RIMS1Q86UR5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
RIMS1Q86UR5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC36.33■■■■□ 3.41
RIMS1Q86UR5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
RIMS1Q86UR5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
RIMS1Q86UR5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
RIMS1Q86UR5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
RIMS1Q86UR5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
RIMS1Q86UR5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
RIMS1Q86UR5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
RIMS1Q86UR5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC36.31■■■■□ 3.4
RIMS1Q86UR5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
RIMS1Q86UR5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
RIMS1Q86UR5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
RIMS1Q86UR5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
RIMS1Q86UR5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
RIMS1Q86UR5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
RIMS1Q86UR5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
RIMS1Q86UR5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
RIMS1Q86UR5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
RIMS1Q86UR5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
RIMS1Q86UR5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
RIMS1Q86UR5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
RIMS1Q86UR5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
RIMS1Q86UR5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
RIMS1Q86UR5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
RIMS1Q86UR5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
RIMS1Q86UR5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
RIMS1Q86UR5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
RIMS1Q86UR5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
RIMS1Q86UR5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
RIMS1Q86UR5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
RIMS1Q86UR5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
RIMS1Q86UR5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
RIMS1Q86UR5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
RIMS1Q86UR5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
RIMS1Q86UR5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
RIMS1Q86UR5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
RIMS1Q86UR5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
RIMS1Q86UR5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
RIMS1Q86UR5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
RIMS1Q86UR5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
RIMS1Q86UR5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
RIMS1Q86UR5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
RIMS1Q86UR5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
RIMS1Q86UR5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
RIMS1Q86UR5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
RIMS1Q86UR5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
RIMS1Q86UR5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
RIMS1Q86UR5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
RIMS1Q86UR5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
RIMS1Q86UR5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
RIMS1Q86UR5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
RIMS1Q86UR5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
RIMS1Q86UR5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
RIMS1Q86UR5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RIMS1Q86UR5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
RIMS1Q86UR5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
RIMS1Q86UR5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
RIMS1Q86UR5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RIMS1Q86UR5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RIMS1Q86UR5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
RIMS1Q86UR5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
RIMS1Q86UR5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
RIMS1Q86UR5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
RIMS1Q86UR5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
RIMS1Q86UR5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
RIMS1Q86UR5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
RIMS1Q86UR5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
RIMS1Q86UR5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
RIMS1Q86UR5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
RIMS1Q86UR5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
RIMS1Q86UR5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
RIMS1Q86UR5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
RIMS1Q86UR5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
RIMS1Q86UR5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
RIMS1Q86UR5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
RIMS1Q86UR5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
RIMS1Q86UR5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
RIMS1Q86UR5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
RIMS1Q86UR5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
RIMS1Q86UR5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
RIMS1Q86UR5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
RIMS1Q86UR5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
RIMS1Q86UR5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
RIMS1Q86UR5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
RIMS1Q86UR5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC36.1■■■■□ 3.37
RIMS1Q86UR5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
RIMS1Q86UR5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
RIMS1Q86UR5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
RIMS1Q86UR5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms