Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y56

Rbsn, Rabenosyn-5, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RbsnQ80Y56 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RbsnQ80Y56 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RbsnQ80Y56 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RbsnQ80Y56 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RbsnQ80Y56 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RbsnQ80Y56 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RbsnQ80Y56 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RbsnQ80Y56 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RbsnQ80Y56 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RbsnQ80Y56 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RbsnQ80Y56 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RbsnQ80Y56 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RbsnQ80Y56 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RbsnQ80Y56 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RbsnQ80Y56 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RbsnQ80Y56 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RbsnQ80Y56 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RbsnQ80Y56 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RbsnQ80Y56 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RbsnQ80Y56 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RbsnQ80Y56 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RbsnQ80Y56 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RbsnQ80Y56 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RbsnQ80Y56 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RbsnQ80Y56 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RbsnQ80Y56 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RbsnQ80Y56 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RbsnQ80Y56 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RbsnQ80Y56 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RbsnQ80Y56 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RbsnQ80Y56 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RbsnQ80Y56 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RbsnQ80Y56 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RbsnQ80Y56 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RbsnQ80Y56 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RbsnQ80Y56 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RbsnQ80Y56 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RbsnQ80Y56 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RbsnQ80Y56 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RbsnQ80Y56 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RbsnQ80Y56 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RbsnQ80Y56 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RbsnQ80Y56 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RbsnQ80Y56 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RbsnQ80Y56 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RbsnQ80Y56 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RbsnQ80Y56 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RbsnQ80Y56 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RbsnQ80Y56 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RbsnQ80Y56 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RbsnQ80Y56 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RbsnQ80Y56 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RbsnQ80Y56 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RbsnQ80Y56 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RbsnQ80Y56 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RbsnQ80Y56 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RbsnQ80Y56 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RbsnQ80Y56 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RbsnQ80Y56 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RbsnQ80Y56 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RbsnQ80Y56 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RbsnQ80Y56 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RbsnQ80Y56 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RbsnQ80Y56 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RbsnQ80Y56 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RbsnQ80Y56 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RbsnQ80Y56 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RbsnQ80Y56 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RbsnQ80Y56 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RbsnQ80Y56 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RbsnQ80Y56 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RbsnQ80Y56 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RbsnQ80Y56 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RbsnQ80Y56 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RbsnQ80Y56 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RbsnQ80Y56 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RbsnQ80Y56 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RbsnQ80Y56 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RbsnQ80Y56 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RbsnQ80Y56 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RbsnQ80Y56 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RbsnQ80Y56 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RbsnQ80Y56 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
RbsnQ80Y56 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RbsnQ80Y56 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RbsnQ80Y56 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RbsnQ80Y56 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RbsnQ80Y56 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RbsnQ80Y56 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RbsnQ80Y56 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RbsnQ80Y56 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RbsnQ80Y56 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RbsnQ80Y56 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RbsnQ80Y56 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RbsnQ80Y56 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RbsnQ80Y56 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RbsnQ80Y56 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RbsnQ80Y56 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RbsnQ80Y56 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RbsnQ80Y56 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms