Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc155Q80VJ8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc155Q80VJ8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc155Q80VJ8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc155Q80VJ8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc155Q80VJ8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc155Q80VJ8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc155Q80VJ8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc155Q80VJ8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc155Q80VJ8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc155Q80VJ8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ccdc155Q80VJ8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ccdc155Q80VJ8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc155Q80VJ8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc155Q80VJ8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc155Q80VJ8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc155Q80VJ8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc155Q80VJ8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc155Q80VJ8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc155Q80VJ8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc155Q80VJ8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc155Q80VJ8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc155Q80VJ8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc155Q80VJ8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc155Q80VJ8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc155Q80VJ8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc155Q80VJ8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc155Q80VJ8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc155Q80VJ8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc155Q80VJ8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc155Q80VJ8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc155Q80VJ8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc155Q80VJ8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc155Q80VJ8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc155Q80VJ8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Ccdc155Q80VJ8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc155Q80VJ8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc155Q80VJ8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc155Q80VJ8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc155Q80VJ8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc155Q80VJ8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc155Q80VJ8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc155Q80VJ8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc155Q80VJ8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc155Q80VJ8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc155Q80VJ8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc155Q80VJ8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc155Q80VJ8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc155Q80VJ8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc155Q80VJ8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc155Q80VJ8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc155Q80VJ8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc155Q80VJ8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc155Q80VJ8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc155Q80VJ8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc155Q80VJ8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc155Q80VJ8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc155Q80VJ8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc155Q80VJ8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc155Q80VJ8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc155Q80VJ8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc155Q80VJ8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc155Q80VJ8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc155Q80VJ8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc155Q80VJ8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc155Q80VJ8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc155Q80VJ8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc155Q80VJ8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ccdc155Q80VJ8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ccdc155Q80VJ8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc155Q80VJ8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc155Q80VJ8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc155Q80VJ8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc155Q80VJ8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc155Q80VJ8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc155Q80VJ8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc155Q80VJ8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc155Q80VJ8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc155Q80VJ8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc155Q80VJ8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc155Q80VJ8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc155Q80VJ8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc155Q80VJ8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc155Q80VJ8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc155Q80VJ8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc155Q80VJ8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc155Q80VJ8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc155Q80VJ8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc155Q80VJ8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc155Q80VJ8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc155Q80VJ8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc155Q80VJ8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc155Q80VJ8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc155Q80VJ8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc155Q80VJ8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc155Q80VJ8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc155Q80VJ8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc155Q80VJ8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc155Q80VJ8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc155Q80VJ8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms