Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RBBP6Q7Z6E9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RBBP6Q7Z6E9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RBBP6Q7Z6E9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RBBP6Q7Z6E9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RBBP6Q7Z6E9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RBBP6Q7Z6E9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RBBP6Q7Z6E9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RBBP6Q7Z6E9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBBP6Q7Z6E9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBBP6Q7Z6E9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RBBP6Q7Z6E9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBBP6Q7Z6E9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBBP6Q7Z6E9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBBP6Q7Z6E9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBBP6Q7Z6E9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBBP6Q7Z6E9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBBP6Q7Z6E9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RBBP6Q7Z6E9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RBBP6Q7Z6E9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RBBP6Q7Z6E9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RBBP6Q7Z6E9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RBBP6Q7Z6E9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RBBP6Q7Z6E9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RBBP6Q7Z6E9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RBBP6Q7Z6E9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RBBP6Q7Z6E9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RBBP6Q7Z6E9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RBBP6Q7Z6E9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RBBP6Q7Z6E9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RBBP6Q7Z6E9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RBBP6Q7Z6E9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RBBP6Q7Z6E9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RBBP6Q7Z6E9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RBBP6Q7Z6E9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RBBP6Q7Z6E9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RBBP6Q7Z6E9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RBBP6Q7Z6E9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RBBP6Q7Z6E9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RBBP6Q7Z6E9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RBBP6Q7Z6E9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RBBP6Q7Z6E9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RBBP6Q7Z6E9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RBBP6Q7Z6E9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RBBP6Q7Z6E9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RBBP6Q7Z6E9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBBP6Q7Z6E9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBBP6Q7Z6E9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBBP6Q7Z6E9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBBP6Q7Z6E9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBBP6Q7Z6E9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RBBP6Q7Z6E9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RBBP6Q7Z6E9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RBBP6Q7Z6E9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RBBP6Q7Z6E9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RBBP6Q7Z6E9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RBBP6Q7Z6E9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RBBP6Q7Z6E9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RBBP6Q7Z6E9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBBP6Q7Z6E9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBBP6Q7Z6E9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
RBBP6Q7Z6E9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RBBP6Q7Z6E9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
RBBP6Q7Z6E9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RBBP6Q7Z6E9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBBP6Q7Z6E9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBBP6Q7Z6E9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBBP6Q7Z6E9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RBBP6Q7Z6E9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBBP6Q7Z6E9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RBBP6Q7Z6E9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RBBP6Q7Z6E9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RBBP6Q7Z6E9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RBBP6Q7Z6E9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RBBP6Q7Z6E9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RBBP6Q7Z6E9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RBBP6Q7Z6E9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RBBP6Q7Z6E9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RBBP6Q7Z6E9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RBBP6Q7Z6E9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RBBP6Q7Z6E9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RBBP6Q7Z6E9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RBBP6Q7Z6E9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RBBP6Q7Z6E9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RBBP6Q7Z6E9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RBBP6Q7Z6E9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RBBP6Q7Z6E9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RBBP6Q7Z6E9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RBBP6Q7Z6E9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RBBP6Q7Z6E9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RBBP6Q7Z6E9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RBBP6Q7Z6E9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RBBP6Q7Z6E9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RBBP6Q7Z6E9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RBBP6Q7Z6E9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RBBP6Q7Z6E9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RBBP6Q7Z6E9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBBP6Q7Z6E9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBBP6Q7Z6E9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBBP6Q7Z6E9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms