Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
KRT28Q7Z3Y7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
KRT28Q7Z3Y7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
KRT28Q7Z3Y7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
KRT28Q7Z3Y7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
KRT28Q7Z3Y7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
KRT28Q7Z3Y7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
KRT28Q7Z3Y7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
KRT28Q7Z3Y7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
KRT28Q7Z3Y7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
KRT28Q7Z3Y7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
KRT28Q7Z3Y7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
KRT28Q7Z3Y7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
KRT28Q7Z3Y7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
KRT28Q7Z3Y7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
KRT28Q7Z3Y7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
KRT28Q7Z3Y7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
KRT28Q7Z3Y7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
KRT28Q7Z3Y7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
KRT28Q7Z3Y7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
KRT28Q7Z3Y7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
KRT28Q7Z3Y7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
KRT28Q7Z3Y7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
KRT28Q7Z3Y7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
KRT28Q7Z3Y7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
KRT28Q7Z3Y7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
KRT28Q7Z3Y7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
KRT28Q7Z3Y7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.93
KRT28Q7Z3Y7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
KRT28Q7Z3Y7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
KRT28Q7Z3Y7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
KRT28Q7Z3Y7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
KRT28Q7Z3Y7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
KRT28Q7Z3Y7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
KRT28Q7Z3Y7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
KRT28Q7Z3Y7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
KRT28Q7Z3Y7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC33.36■■■□□ 2.93
KRT28Q7Z3Y7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
KRT28Q7Z3Y7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
KRT28Q7Z3Y7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
KRT28Q7Z3Y7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
KRT28Q7Z3Y7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
KRT28Q7Z3Y7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
KRT28Q7Z3Y7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
KRT28Q7Z3Y7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
KRT28Q7Z3Y7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
KRT28Q7Z3Y7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
KRT28Q7Z3Y7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
KRT28Q7Z3Y7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
KRT28Q7Z3Y7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
KRT28Q7Z3Y7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
KRT28Q7Z3Y7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
KRT28Q7Z3Y7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
KRT28Q7Z3Y7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
KRT28Q7Z3Y7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
KRT28Q7Z3Y7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
KRT28Q7Z3Y7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
KRT28Q7Z3Y7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
KRT28Q7Z3Y7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
KRT28Q7Z3Y7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
KRT28Q7Z3Y7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
KRT28Q7Z3Y7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
KRT28Q7Z3Y7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
KRT28Q7Z3Y7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC33.29■■■□□ 2.92
KRT28Q7Z3Y7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
KRT28Q7Z3Y7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
KRT28Q7Z3Y7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
KRT28Q7Z3Y7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
KRT28Q7Z3Y7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
KRT28Q7Z3Y7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
KRT28Q7Z3Y7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
KRT28Q7Z3Y7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
KRT28Q7Z3Y7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
KRT28Q7Z3Y7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
KRT28Q7Z3Y7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
KRT28Q7Z3Y7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
KRT28Q7Z3Y7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
KRT28Q7Z3Y7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
KRT28Q7Z3Y7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
KRT28Q7Z3Y7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
KRT28Q7Z3Y7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
KRT28Q7Z3Y7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
KRT28Q7Z3Y7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
KRT28Q7Z3Y7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
KRT28Q7Z3Y7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
KRT28Q7Z3Y7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
KRT28Q7Z3Y7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
KRT28Q7Z3Y7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
KRT28Q7Z3Y7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
KRT28Q7Z3Y7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
KRT28Q7Z3Y7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
KRT28Q7Z3Y7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
KRT28Q7Z3Y7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
KRT28Q7Z3Y7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
KRT28Q7Z3Y7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
KRT28Q7Z3Y7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
KRT28Q7Z3Y7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
KRT28Q7Z3Y7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
KRT28Q7Z3Y7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
KRT28Q7Z3Y7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms