Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Prrc2bQ7TPM1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Prrc2bQ7TPM1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Prrc2bQ7TPM1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Prrc2bQ7TPM1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Prrc2bQ7TPM1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Prrc2bQ7TPM1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Prrc2bQ7TPM1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Prrc2bQ7TPM1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Prrc2bQ7TPM1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Prrc2bQ7TPM1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Prrc2bQ7TPM1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Prrc2bQ7TPM1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Prrc2bQ7TPM1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Prrc2bQ7TPM1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Prrc2bQ7TPM1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Prrc2bQ7TPM1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Prrc2bQ7TPM1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Prrc2bQ7TPM1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Prrc2bQ7TPM1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Prrc2bQ7TPM1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Prrc2bQ7TPM1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Prrc2bQ7TPM1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Prrc2bQ7TPM1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Prrc2bQ7TPM1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Prrc2bQ7TPM1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Prrc2bQ7TPM1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Prrc2bQ7TPM1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Prrc2bQ7TPM1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Prrc2bQ7TPM1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Prrc2bQ7TPM1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Prrc2bQ7TPM1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Prrc2bQ7TPM1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Prrc2bQ7TPM1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
Prrc2bQ7TPM1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Prrc2bQ7TPM1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Prrc2bQ7TPM1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Prrc2bQ7TPM1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Prrc2bQ7TPM1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Prrc2bQ7TPM1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Prrc2bQ7TPM1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Prrc2bQ7TPM1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Prrc2bQ7TPM1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Prrc2bQ7TPM1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Prrc2bQ7TPM1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Prrc2bQ7TPM1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Prrc2bQ7TPM1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Prrc2bQ7TPM1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Prrc2bQ7TPM1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Prrc2bQ7TPM1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Prrc2bQ7TPM1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Prrc2bQ7TPM1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Prrc2bQ7TPM1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Prrc2bQ7TPM1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Prrc2bQ7TPM1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Prrc2bQ7TPM1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Prrc2bQ7TPM1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Prrc2bQ7TPM1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Prrc2bQ7TPM1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Prrc2bQ7TPM1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Prrc2bQ7TPM1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Prrc2bQ7TPM1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Prrc2bQ7TPM1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Prrc2bQ7TPM1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Prrc2bQ7TPM1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Prrc2bQ7TPM1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Prrc2bQ7TPM1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Prrc2bQ7TPM1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Prrc2bQ7TPM1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Prrc2bQ7TPM1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Prrc2bQ7TPM1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Prrc2bQ7TPM1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Prrc2bQ7TPM1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Prrc2bQ7TPM1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Prrc2bQ7TPM1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Prrc2bQ7TPM1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Prrc2bQ7TPM1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Prrc2bQ7TPM1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Prrc2bQ7TPM1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Prrc2bQ7TPM1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Prrc2bQ7TPM1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Prrc2bQ7TPM1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
Prrc2bQ7TPM1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Prrc2bQ7TPM1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Prrc2bQ7TPM1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Prrc2bQ7TPM1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Prrc2bQ7TPM1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Prrc2bQ7TPM1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Prrc2bQ7TPM1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Prrc2bQ7TPM1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Prrc2bQ7TPM1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Prrc2bQ7TPM1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Prrc2bQ7TPM1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Prrc2bQ7TPM1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Prrc2bQ7TPM1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
Prrc2bQ7TPM1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Prrc2bQ7TPM1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Prrc2bQ7TPM1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Prrc2bQ7TPM1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Prrc2bQ7TPM1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 496.1 ms