Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Scn4bQ7M729 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Scn4bQ7M729 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scn4bQ7M729 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scn4bQ7M729 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scn4bQ7M729 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Scn4bQ7M729 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Scn4bQ7M729 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Scn4bQ7M729 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Scn4bQ7M729 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scn4bQ7M729 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scn4bQ7M729 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Scn4bQ7M729 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scn4bQ7M729 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scn4bQ7M729 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scn4bQ7M729 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scn4bQ7M729 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scn4bQ7M729 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scn4bQ7M729 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scn4bQ7M729 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scn4bQ7M729 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scn4bQ7M729 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Scn4bQ7M729 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Scn4bQ7M729 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scn4bQ7M729 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scn4bQ7M729 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scn4bQ7M729 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Scn4bQ7M729 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scn4bQ7M729 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scn4bQ7M729 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scn4bQ7M729 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scn4bQ7M729 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scn4bQ7M729 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Scn4bQ7M729 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scn4bQ7M729 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scn4bQ7M729 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scn4bQ7M729 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Scn4bQ7M729 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Scn4bQ7M729 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Scn4bQ7M729 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Scn4bQ7M729 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scn4bQ7M729 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scn4bQ7M729 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scn4bQ7M729 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scn4bQ7M729 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scn4bQ7M729 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scn4bQ7M729 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Scn4bQ7M729 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scn4bQ7M729 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scn4bQ7M729 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scn4bQ7M729 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scn4bQ7M729 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scn4bQ7M729 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scn4bQ7M729 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scn4bQ7M729 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scn4bQ7M729 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scn4bQ7M729 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scn4bQ7M729 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scn4bQ7M729 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scn4bQ7M729 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scn4bQ7M729 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scn4bQ7M729 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scn4bQ7M729 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scn4bQ7M729 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scn4bQ7M729 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scn4bQ7M729 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scn4bQ7M729 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scn4bQ7M729 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scn4bQ7M729 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scn4bQ7M729 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scn4bQ7M729 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scn4bQ7M729 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scn4bQ7M729 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scn4bQ7M729 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scn4bQ7M729 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scn4bQ7M729 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scn4bQ7M729 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scn4bQ7M729 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scn4bQ7M729 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scn4bQ7M729 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scn4bQ7M729 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Scn4bQ7M729 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scn4bQ7M729 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scn4bQ7M729 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scn4bQ7M729 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scn4bQ7M729 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Scn4bQ7M729 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scn4bQ7M729 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Scn4bQ7M729 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scn4bQ7M729 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scn4bQ7M729 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scn4bQ7M729 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scn4bQ7M729 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scn4bQ7M729 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Scn4bQ7M729 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scn4bQ7M729 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scn4bQ7M729 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scn4bQ7M729 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scn4bQ7M729 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scn4bQ7M729 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms