Protein–RNA interactions for Protein: Q7L2E3

DHX30, Putative ATP-dependent RNA helicase DHX30, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX30Q7L2E3 USF2-204ENST00000593708 474 ntTSL 325.71■■□□□ 1.713e-6■■■■■ 31.5
DHX30Q7L2E3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.613e-6■■■■■ 31.5
DHX30Q7L2E3 USF2-216ENST00000607959 1920 ntTSL 524.67■■□□□ 1.543e-6■■■■■ 31.5
DHX30Q7L2E3 USF2-210ENST00000598058 510 ntTSL 223.23■■□□□ 1.313e-6■■■■■ 31.5
DHX30Q7L2E3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.263e-6■■■■■ 31.5
DHX30Q7L2E3 TMEM121-203ENST00000552019 366 ntTSL 522.38■■□□□ 1.173e-6■■■■■ 31.5
DHX30Q7L2E3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.073e-6■■■■■ 31.5
DHX30Q7L2E3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.013e-6■■■■■ 31.5
DHX30Q7L2E3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.963e-6■■■■■ 31.5
DHX30Q7L2E3 ST6GALNAC5-201ENST00000318803 2055 ntTSL 518.2■□□□□ 0.53e-6■■■■■ 31.5
DHX30Q7L2E3 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.313e-6■■■■■ 31.5
DHX30Q7L2E3 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.163e-6■■■■■ 31.5
DHX30Q7L2E3 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.053e-6■■■■■ 31.5
DHX30Q7L2E3 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.093e-6■■■■■ 31.5
DHX30Q7L2E3 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.13e-6■■■■■ 31.5
DHX30Q7L2E3 SLC12A7-206ENST00000634447 3142 ntTSL 514.37□□□□□ -0.113e-6■■■■■ 31.5
DHX30Q7L2E3 FBXO16-210ENST00000521548 2983 ntTSL 214.27□□□□□ -0.123e-6■■■■■ 31.5
DHX30Q7L2E3 TMBIM1-219ENST00000465082 2874 ntTSL 213.65□□□□□ -0.223e-6■■■■■ 31.5
DHX30Q7L2E3 FBXO16-201ENST00000346498 1205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.273e-6■■■■■ 31.5
DHX30Q7L2E3 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.313e-6■■■■■ 31.5
DHX30Q7L2E3 FBXO16-209ENST00000520481 598 ntTSL 312.66□□□□□ -0.383e-6■■■■■ 31.5
DHX30Q7L2E3 TMBIM1-214ENST00000444881 2936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.473e-6■■■■■ 31.5
DHX30Q7L2E3 ST6GALNAC5-202ENST00000477717 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.483e-6■■■■■ 31.5
DHX30Q7L2E3 FBXO16-203ENST00000517436 554 ntTSL 411.24□□□□□ -0.613e-6■■■■■ 31.5
DHX30Q7L2E3 FBXO16-205ENST00000518016 495 ntTSL 59.35□□□□□ -0.913e-6■■■■■ 31.5
DHX30Q7L2E3 FBXO16-204ENST00000517673 607 ntTSL 59.35□□□□□ -0.913e-6■■■■■ 31.5
DHX30Q7L2E3 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.983e-6■■■■■ 31.5
DHX30Q7L2E3 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.167e-7■■■■■ 31.5
DHX30Q7L2E3 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.192e-7■■■■■ 31.4
DHX30Q7L2E3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.242e-6■■■■■ 31.4
DHX30Q7L2E3 DHRSX-207ENST00000478825 679 ntTSL 226.74■■□□□ 1.872e-9■■■■■ 31.4
DHX30Q7L2E3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.772e-9■■■■■ 31.4
DHX30Q7L2E3 DHRSX-203ENST00000430536 490 ntTSL 225.25■■□□□ 1.632e-9■■■■■ 31.4
DHX30Q7L2E3 DHRSX-202ENST00000412516 744 ntTSL 224.4■■□□□ 1.52e-9■■■■■ 31.4
DHX30Q7L2E3 DHRSX-205ENST00000444280 797 ntTSL 220.31■□□□□ 0.842e-9■■■■■ 31.4
DHX30Q7L2E3 ZNF518B-205ENST00000515072 2623 ntTSL 1 (best)17.22■□□□□ 0.352e-9■■■■■ 31.4
DHX30Q7L2E3 ZBED1-204ENST00000461691 947 ntTSL 216.56■□□□□ 0.242e-9■■■■■ 31.4
DHX30Q7L2E3 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.22e-9■■■■■ 31.4
DHX30Q7L2E3 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.022e-9■■■■■ 31.4
DHX30Q7L2E3 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.022e-9■■■■■ 31.4
DHX30Q7L2E3 HFM1-202ENST00000427444 672 ntTSL 513.96□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 31.4
DHX30Q7L2E3 ZNF518B-204ENST00000507515 527 ntTSL 412.4□□□□□ -0.422e-9■■■■■ 31.4
DHX30Q7L2E3 HFM1-204ENST00000448819 540 ntTSL 512.11□□□□□ -0.472e-6■■■■■ 31.4
DHX30Q7L2E3 ZNF518B-203ENST00000503068 4196 ntTSL 1 (best)11.43□□□□□ -0.582e-9■■■■■ 31.4
DHX30Q7L2E3 DHRSX-204ENST00000441131 539 ntTSL 28.97□□□□□ -0.972e-9■■■■■ 31.4
DHX30Q7L2E3 ZNF518B-202ENST00000500268 4145 ntTSL 1 (best)8.75□□□□□ -1.012e-9■■■■■ 31.4
DHX30Q7L2E3 HFM1-208ENST00000488023 1699 ntTSL 57□□□□□ -1.292e-6■■■■■ 31.4
DHX30Q7L2E3 HFM1-207ENST00000481900 2020 ntTSL 56.68□□□□□ -1.342e-6■■■■■ 31.4
DHX30Q7L2E3 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.492e-9■■■■■ 31.4
DHX30Q7L2E3 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.992e-6■■■■■ 31.4
DHX30Q7L2E3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.561e-6■■■■■ 31.4
DHX30Q7L2E3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.51e-6■■■■■ 31.4
DHX30Q7L2E3 EHMT1-237ENST00000637261 4208 ntTSL 510.58□□□□□ -0.721e-6■■■■■ 31.4
DHX30Q7L2E3 CCNY-209ENST00000493157 816 ntTSL 520.17■□□□□ 0.821e-7■■■■■ 31.1
DHX30Q7L2E3 CCNY-207ENST00000490012 793 ntTSL 318.48■□□□□ 0.551e-7■■■■■ 31.1
DHX30Q7L2E3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.231e-7■■■■■ 31.1
DHX30Q7L2E3 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.071e-7■■■■■ 31.1
DHX30Q7L2E3 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.211e-7■■■■■ 31.1
DHX30Q7L2E3 CCNY-204ENST00000374706 3940 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.581e-7■■■■■ 31.1
DHX30Q7L2E3 CCNY-208ENST00000492478 809 ntTSL 510.78□□□□□ -0.681e-7■■■■■ 31.1
DHX30Q7L2E3 CCNY-206ENST00000470025 346 ntTSL 56.17□□□□□ -1.421e-7■■■■■ 31.1
DHX30Q7L2E3 MAD1L1-219ENST00000481633 548 ntTSL 216.86■□□□□ 0.298e-7■■■■■ 31
DHX30Q7L2E3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.984e-7■■■■■ 31
DHX30Q7L2E3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.153e-6■■■■■ 31
DHX30Q7L2E3 PKP4-204ENST00000421462 3099 ntTSL 217.39■□□□□ 0.384e-7■■■■■ 30.9
DHX30Q7L2E3 GSE1-204ENST00000411612 872 ntTSL 525.74■■□□□ 1.718e-7■■■■■ 30.9
DHX30Q7L2E3 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.168e-7■■■■■ 30.9
DHX30Q7L2E3 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.228e-7■■■■■ 30.9
DHX30Q7L2E3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.493e-6■■■■■ 30.9
DHX30Q7L2E3 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.143e-6■■■■■ 30.8
DHX30Q7L2E3 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.133e-6■■■■■ 30.8
DHX30Q7L2E3 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.13e-6■■■■■ 30.8
DHX30Q7L2E3 CD81-205ENST00000475945 606 ntTSL 220.73■□□□□ 0.911e-6■■■■■ 30.8
DHX30Q7L2E3 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.51e-6■■■■■ 30.8
DHX30Q7L2E3 CD81-215ENST00000530648 558 ntTSL 415.99■□□□□ 0.151e-6■■■■■ 30.8
DHX30Q7L2E3 STRBP-203ENST00000407982 2751 ntTSL 1 (best)23.63■■□□□ 1.372e-7■■■■■ 30.8
DHX30Q7L2E3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.362e-7■■■■■ 30.8
DHX30Q7L2E3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.862e-7■■■■■ 30.8
DHX30Q7L2E3 MAD1L1-212ENST00000450235 850 ntTSL 320.14■□□□□ 0.811e-6■■■■■ 30.8
DHX30Q7L2E3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.522e-6■■■■■ 30.8
DHX30Q7L2E3 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC7.91□□□□□ -1.143e-9■■■■■ 30.7
DHX30Q7L2E3 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 30.7
DHX30Q7L2E3 CBFA2T3-204ENST00000563640 664 ntTSL 218.53■□□□□ 0.566e-7■■■■■ 30.7
DHX30Q7L2E3 CKB-206ENST00000553994 746 ntTSL 234.28■■■■□ 3.082e-13■■■■■ 30.7
DHX30Q7L2E3 CKB-205ENST00000553878 856 ntTSL 234.28■■■■□ 3.082e-13■■■■■ 30.7
DHX30Q7L2E3 CKB-214ENST00000555770 816 ntTSL 431.53■■■□□ 2.642e-13■■■■■ 30.7
DHX30Q7L2E3 CKB-208ENST00000554426 775 ntTSL 531.5■■■□□ 2.632e-13■■■■■ 30.7
DHX30Q7L2E3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.842e-13■■■■■ 30.7
DHX30Q7L2E3 CKB-209ENST00000554705 803 ntTSL 222.69■■□□□ 1.222e-13■■■■■ 30.7
DHX30Q7L2E3 CKB-213ENST00000555659 755 ntTSL 222.59■■□□□ 1.212e-13■■■■■ 30.7
DHX30Q7L2E3 CKB-204ENST00000553652 1239 ntTSL 520.19■□□□□ 0.822e-13■■■■■ 30.7
DHX30Q7L2E3 CKB-216ENST00000557530 523 ntTSL 415.43■□□□□ 0.062e-13■■■■■ 30.7
DHX30Q7L2E3 AHDC1-203ENST00000480033 546 ntTSL 521.59■■□□□ 1.052e-6■■■■■ 30.6
DHX30Q7L2E3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.243e-6■■■■■ 30.5
DHX30Q7L2E3 KLHDC4-207ENST00000562155 1757 ntTSL 522.68■■□□□ 1.223e-6■■■■■ 30.5
DHX30Q7L2E3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.163e-6■■■■■ 30.5
DHX30Q7L2E3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.163e-6■■■■■ 30.5
DHX30Q7L2E3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.053e-6■■■■■ 30.5
DHX30Q7L2E3 KLHDC4-202ENST00000316853 1287 ntTSL 1 (best)21.19■□□□□ 0.983e-6■■■■■ 30.5
DHX30Q7L2E3 KLHDC4-215ENST00000566349 1377 ntTSL 220.03■□□□□ 0.83e-6■■■■■ 30.5
Retrieved 100 of 5,617 protein–RNA pairs in 54.6 ms