Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1I2

SV2B, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2BQ7L1I2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SV2BQ7L1I2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SV2BQ7L1I2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SV2BQ7L1I2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SV2BQ7L1I2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SV2BQ7L1I2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SV2BQ7L1I2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SV2BQ7L1I2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SV2BQ7L1I2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SV2BQ7L1I2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SV2BQ7L1I2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SV2BQ7L1I2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SV2BQ7L1I2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SV2BQ7L1I2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SV2BQ7L1I2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SV2BQ7L1I2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SV2BQ7L1I2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SV2BQ7L1I2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SV2BQ7L1I2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SV2BQ7L1I2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SV2BQ7L1I2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SV2BQ7L1I2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SV2BQ7L1I2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SV2BQ7L1I2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SV2BQ7L1I2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SV2BQ7L1I2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SV2BQ7L1I2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SV2BQ7L1I2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SV2BQ7L1I2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SV2BQ7L1I2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SV2BQ7L1I2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SV2BQ7L1I2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SV2BQ7L1I2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SV2BQ7L1I2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SV2BQ7L1I2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SV2BQ7L1I2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SV2BQ7L1I2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SV2BQ7L1I2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SV2BQ7L1I2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SV2BQ7L1I2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SV2BQ7L1I2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SV2BQ7L1I2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SV2BQ7L1I2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SV2BQ7L1I2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SV2BQ7L1I2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SV2BQ7L1I2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SV2BQ7L1I2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SV2BQ7L1I2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SV2BQ7L1I2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SV2BQ7L1I2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SV2BQ7L1I2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SV2BQ7L1I2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SV2BQ7L1I2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SV2BQ7L1I2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SV2BQ7L1I2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SV2BQ7L1I2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SV2BQ7L1I2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SV2BQ7L1I2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SV2BQ7L1I2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SV2BQ7L1I2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SV2BQ7L1I2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SV2BQ7L1I2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SV2BQ7L1I2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SV2BQ7L1I2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SV2BQ7L1I2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SV2BQ7L1I2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SV2BQ7L1I2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SV2BQ7L1I2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SV2BQ7L1I2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SV2BQ7L1I2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SV2BQ7L1I2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SV2BQ7L1I2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SV2BQ7L1I2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SV2BQ7L1I2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SV2BQ7L1I2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SV2BQ7L1I2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SV2BQ7L1I2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SV2BQ7L1I2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SV2BQ7L1I2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SV2BQ7L1I2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SV2BQ7L1I2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SV2BQ7L1I2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SV2BQ7L1I2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SV2BQ7L1I2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SV2BQ7L1I2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SV2BQ7L1I2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SV2BQ7L1I2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SV2BQ7L1I2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SV2BQ7L1I2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SV2BQ7L1I2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SV2BQ7L1I2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SV2BQ7L1I2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SV2BQ7L1I2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SV2BQ7L1I2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SV2BQ7L1I2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SV2BQ7L1I2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SV2BQ7L1I2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SV2BQ7L1I2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SV2BQ7L1I2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SV2BQ7L1I2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms