Protein–RNA interactions for Protein: Q7JJ13

Brd2, Bromodomain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd2Q7JJ13 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brd2Q7JJ13 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Brd2Q7JJ13 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brd2Q7JJ13 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brd2Q7JJ13 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brd2Q7JJ13 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brd2Q7JJ13 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brd2Q7JJ13 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Brd2Q7JJ13 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Brd2Q7JJ13 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Brd2Q7JJ13 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Brd2Q7JJ13 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Brd2Q7JJ13 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Brd2Q7JJ13 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Brd2Q7JJ13 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Brd2Q7JJ13 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Brd2Q7JJ13 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Brd2Q7JJ13 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brd2Q7JJ13 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brd2Q7JJ13 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Brd2Q7JJ13 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Brd2Q7JJ13 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Brd2Q7JJ13 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Brd2Q7JJ13 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Brd2Q7JJ13 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Brd2Q7JJ13 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brd2Q7JJ13 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brd2Q7JJ13 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Brd2Q7JJ13 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brd2Q7JJ13 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brd2Q7JJ13 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brd2Q7JJ13 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brd2Q7JJ13 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brd2Q7JJ13 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brd2Q7JJ13 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brd2Q7JJ13 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brd2Q7JJ13 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brd2Q7JJ13 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brd2Q7JJ13 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brd2Q7JJ13 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brd2Q7JJ13 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brd2Q7JJ13 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Brd2Q7JJ13 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Brd2Q7JJ13 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Brd2Q7JJ13 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Brd2Q7JJ13 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Brd2Q7JJ13 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brd2Q7JJ13 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brd2Q7JJ13 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brd2Q7JJ13 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brd2Q7JJ13 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brd2Q7JJ13 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brd2Q7JJ13 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brd2Q7JJ13 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brd2Q7JJ13 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brd2Q7JJ13 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Brd2Q7JJ13 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Brd2Q7JJ13 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Brd2Q7JJ13 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Brd2Q7JJ13 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Brd2Q7JJ13 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Brd2Q7JJ13 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Brd2Q7JJ13 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brd2Q7JJ13 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brd2Q7JJ13 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brd2Q7JJ13 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brd2Q7JJ13 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Brd2Q7JJ13 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brd2Q7JJ13 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brd2Q7JJ13 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brd2Q7JJ13 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brd2Q7JJ13 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Brd2Q7JJ13 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Brd2Q7JJ13 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Brd2Q7JJ13 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Brd2Q7JJ13 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Brd2Q7JJ13 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Brd2Q7JJ13 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Brd2Q7JJ13 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Brd2Q7JJ13 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Brd2Q7JJ13 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Brd2Q7JJ13 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brd2Q7JJ13 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brd2Q7JJ13 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brd2Q7JJ13 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brd2Q7JJ13 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brd2Q7JJ13 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Brd2Q7JJ13 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Brd2Q7JJ13 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Brd2Q7JJ13 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Brd2Q7JJ13 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Brd2Q7JJ13 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Brd2Q7JJ13 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Brd2Q7JJ13 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brd2Q7JJ13 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brd2Q7JJ13 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Brd2Q7JJ13 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brd2Q7JJ13 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brd2Q7JJ13 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brd2Q7JJ13 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms