Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc6aQ78XR0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc6aQ78XR0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc6aQ78XR0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc6aQ78XR0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc6aQ78XR0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc6aQ78XR0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc6aQ78XR0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc6aQ78XR0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc6aQ78XR0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc6aQ78XR0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc6aQ78XR0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc6aQ78XR0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc6aQ78XR0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trappc6aQ78XR0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trappc6aQ78XR0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trappc6aQ78XR0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc6aQ78XR0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc6aQ78XR0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc6aQ78XR0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc6aQ78XR0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc6aQ78XR0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc6aQ78XR0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc6aQ78XR0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc6aQ78XR0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc6aQ78XR0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc6aQ78XR0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc6aQ78XR0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc6aQ78XR0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc6aQ78XR0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc6aQ78XR0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc6aQ78XR0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc6aQ78XR0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc6aQ78XR0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc6aQ78XR0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc6aQ78XR0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc6aQ78XR0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc6aQ78XR0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc6aQ78XR0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc6aQ78XR0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc6aQ78XR0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc6aQ78XR0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc6aQ78XR0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc6aQ78XR0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc6aQ78XR0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc6aQ78XR0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc6aQ78XR0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc6aQ78XR0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc6aQ78XR0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc6aQ78XR0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc6aQ78XR0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc6aQ78XR0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc6aQ78XR0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc6aQ78XR0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc6aQ78XR0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trappc6aQ78XR0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc6aQ78XR0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc6aQ78XR0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc6aQ78XR0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc6aQ78XR0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc6aQ78XR0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc6aQ78XR0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc6aQ78XR0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc6aQ78XR0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc6aQ78XR0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc6aQ78XR0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc6aQ78XR0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc6aQ78XR0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc6aQ78XR0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc6aQ78XR0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc6aQ78XR0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc6aQ78XR0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc6aQ78XR0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc6aQ78XR0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc6aQ78XR0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc6aQ78XR0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc6aQ78XR0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc6aQ78XR0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc6aQ78XR0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc6aQ78XR0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc6aQ78XR0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc6aQ78XR0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc6aQ78XR0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc6aQ78XR0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc6aQ78XR0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc6aQ78XR0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc6aQ78XR0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc6aQ78XR0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc6aQ78XR0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc6aQ78XR0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc6aQ78XR0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc6aQ78XR0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc6aQ78XR0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc6aQ78XR0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc6aQ78XR0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc6aQ78XR0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc6aQ78XR0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc6aQ78XR0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Trappc6aQ78XR0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc6aQ78XR0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms