Protein–RNA interactions for Protein: Q78PG9

Ccdc25, Coiled-coil domain-containing protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc25Q78PG9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc25Q78PG9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc25Q78PG9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc25Q78PG9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc25Q78PG9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc25Q78PG9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc25Q78PG9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc25Q78PG9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc25Q78PG9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc25Q78PG9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc25Q78PG9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc25Q78PG9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc25Q78PG9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc25Q78PG9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc25Q78PG9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc25Q78PG9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc25Q78PG9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc25Q78PG9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc25Q78PG9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc25Q78PG9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc25Q78PG9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc25Q78PG9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc25Q78PG9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc25Q78PG9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc25Q78PG9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc25Q78PG9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc25Q78PG9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc25Q78PG9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc25Q78PG9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc25Q78PG9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc25Q78PG9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc25Q78PG9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc25Q78PG9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc25Q78PG9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc25Q78PG9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc25Q78PG9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc25Q78PG9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc25Q78PG9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc25Q78PG9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc25Q78PG9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc25Q78PG9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc25Q78PG9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc25Q78PG9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc25Q78PG9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc25Q78PG9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc25Q78PG9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc25Q78PG9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc25Q78PG9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc25Q78PG9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc25Q78PG9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc25Q78PG9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc25Q78PG9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc25Q78PG9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc25Q78PG9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc25Q78PG9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc25Q78PG9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc25Q78PG9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc25Q78PG9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc25Q78PG9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc25Q78PG9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc25Q78PG9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc25Q78PG9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc25Q78PG9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc25Q78PG9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc25Q78PG9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc25Q78PG9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc25Q78PG9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc25Q78PG9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc25Q78PG9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc25Q78PG9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc25Q78PG9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc25Q78PG9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc25Q78PG9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc25Q78PG9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc25Q78PG9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc25Q78PG9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc25Q78PG9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc25Q78PG9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc25Q78PG9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc25Q78PG9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc25Q78PG9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc25Q78PG9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc25Q78PG9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc25Q78PG9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc25Q78PG9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc25Q78PG9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc25Q78PG9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc25Q78PG9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc25Q78PG9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc25Q78PG9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc25Q78PG9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc25Q78PG9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc25Q78PG9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc25Q78PG9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc25Q78PG9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc25Q78PG9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc25Q78PG9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc25Q78PG9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc25Q78PG9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc25Q78PG9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 272.5 ms