Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd3eapQ76KJ5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd3eapQ76KJ5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd3eapQ76KJ5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd3eapQ76KJ5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd3eapQ76KJ5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd3eapQ76KJ5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd3eapQ76KJ5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd3eapQ76KJ5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd3eapQ76KJ5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd3eapQ76KJ5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd3eapQ76KJ5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd3eapQ76KJ5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd3eapQ76KJ5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd3eapQ76KJ5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd3eapQ76KJ5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd3eapQ76KJ5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd3eapQ76KJ5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd3eapQ76KJ5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd3eapQ76KJ5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd3eapQ76KJ5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd3eapQ76KJ5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd3eapQ76KJ5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd3eapQ76KJ5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd3eapQ76KJ5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd3eapQ76KJ5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd3eapQ76KJ5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd3eapQ76KJ5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd3eapQ76KJ5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd3eapQ76KJ5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd3eapQ76KJ5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd3eapQ76KJ5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd3eapQ76KJ5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd3eapQ76KJ5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd3eapQ76KJ5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd3eapQ76KJ5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd3eapQ76KJ5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd3eapQ76KJ5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd3eapQ76KJ5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd3eapQ76KJ5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd3eapQ76KJ5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd3eapQ76KJ5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd3eapQ76KJ5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd3eapQ76KJ5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd3eapQ76KJ5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd3eapQ76KJ5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd3eapQ76KJ5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd3eapQ76KJ5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd3eapQ76KJ5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd3eapQ76KJ5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd3eapQ76KJ5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd3eapQ76KJ5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd3eapQ76KJ5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd3eapQ76KJ5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd3eapQ76KJ5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd3eapQ76KJ5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd3eapQ76KJ5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd3eapQ76KJ5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd3eapQ76KJ5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd3eapQ76KJ5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd3eapQ76KJ5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd3eapQ76KJ5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cd3eapQ76KJ5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cd3eapQ76KJ5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cd3eapQ76KJ5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd3eapQ76KJ5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd3eapQ76KJ5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd3eapQ76KJ5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd3eapQ76KJ5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd3eapQ76KJ5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd3eapQ76KJ5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd3eapQ76KJ5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd3eapQ76KJ5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd3eapQ76KJ5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd3eapQ76KJ5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd3eapQ76KJ5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd3eapQ76KJ5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd3eapQ76KJ5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd3eapQ76KJ5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd3eapQ76KJ5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd3eapQ76KJ5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd3eapQ76KJ5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd3eapQ76KJ5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd3eapQ76KJ5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd3eapQ76KJ5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd3eapQ76KJ5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd3eapQ76KJ5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd3eapQ76KJ5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd3eapQ76KJ5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd3eapQ76KJ5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd3eapQ76KJ5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd3eapQ76KJ5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd3eapQ76KJ5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd3eapQ76KJ5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd3eapQ76KJ5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd3eapQ76KJ5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd3eapQ76KJ5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cd3eapQ76KJ5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd3eapQ76KJ5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd3eapQ76KJ5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms