Protein–RNA interactions for Protein: Q71UM5

RPS27L, 40S ribosomal protein S27-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS27LQ71UM5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS27LQ71UM5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS27LQ71UM5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS27LQ71UM5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS27LQ71UM5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS27LQ71UM5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS27LQ71UM5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS27LQ71UM5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPS27LQ71UM5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS27LQ71UM5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS27LQ71UM5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS27LQ71UM5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS27LQ71UM5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS27LQ71UM5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS27LQ71UM5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS27LQ71UM5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS27LQ71UM5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS27LQ71UM5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS27LQ71UM5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS27LQ71UM5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS27LQ71UM5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS27LQ71UM5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS27LQ71UM5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS27LQ71UM5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS27LQ71UM5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS27LQ71UM5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS27LQ71UM5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS27LQ71UM5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS27LQ71UM5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS27LQ71UM5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS27LQ71UM5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS27LQ71UM5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS27LQ71UM5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS27LQ71UM5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS27LQ71UM5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS27LQ71UM5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS27LQ71UM5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS27LQ71UM5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS27LQ71UM5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS27LQ71UM5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS27LQ71UM5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS27LQ71UM5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS27LQ71UM5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS27LQ71UM5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS27LQ71UM5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS27LQ71UM5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPS27LQ71UM5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS27LQ71UM5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS27LQ71UM5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS27LQ71UM5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS27LQ71UM5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS27LQ71UM5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS27LQ71UM5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS27LQ71UM5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS27LQ71UM5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS27LQ71UM5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS27LQ71UM5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS27LQ71UM5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS27LQ71UM5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS27LQ71UM5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS27LQ71UM5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS27LQ71UM5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS27LQ71UM5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS27LQ71UM5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS27LQ71UM5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS27LQ71UM5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS27LQ71UM5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS27LQ71UM5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS27LQ71UM5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS27LQ71UM5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS27LQ71UM5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS27LQ71UM5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS27LQ71UM5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS27LQ71UM5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS27LQ71UM5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS27LQ71UM5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS27LQ71UM5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS27LQ71UM5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS27LQ71UM5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS27LQ71UM5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS27LQ71UM5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS27LQ71UM5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS27LQ71UM5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS27LQ71UM5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS27LQ71UM5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS27LQ71UM5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS27LQ71UM5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS27LQ71UM5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS27LQ71UM5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS27LQ71UM5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS27LQ71UM5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS27LQ71UM5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS27LQ71UM5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS27LQ71UM5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS27LQ71UM5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS27LQ71UM5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS27LQ71UM5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS27LQ71UM5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS27LQ71UM5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS27LQ71UM5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms