Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV50

RFX8, DNA-binding protein RFX8, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8Q6ZV50 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFX8Q6ZV50 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RFX8Q6ZV50 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFX8Q6ZV50 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFX8Q6ZV50 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RFX8Q6ZV50 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFX8Q6ZV50 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFX8Q6ZV50 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFX8Q6ZV50 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFX8Q6ZV50 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFX8Q6ZV50 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFX8Q6ZV50 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFX8Q6ZV50 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFX8Q6ZV50 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFX8Q6ZV50 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFX8Q6ZV50 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RFX8Q6ZV50 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFX8Q6ZV50 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFX8Q6ZV50 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RFX8Q6ZV50 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RFX8Q6ZV50 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RFX8Q6ZV50 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RFX8Q6ZV50 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RFX8Q6ZV50 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RFX8Q6ZV50 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RFX8Q6ZV50 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RFX8Q6ZV50 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RFX8Q6ZV50 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFX8Q6ZV50 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFX8Q6ZV50 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RFX8Q6ZV50 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFX8Q6ZV50 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFX8Q6ZV50 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFX8Q6ZV50 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RFX8Q6ZV50 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RFX8Q6ZV50 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RFX8Q6ZV50 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RFX8Q6ZV50 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RFX8Q6ZV50 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RFX8Q6ZV50 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RFX8Q6ZV50 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RFX8Q6ZV50 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RFX8Q6ZV50 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RFX8Q6ZV50 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RFX8Q6ZV50 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RFX8Q6ZV50 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RFX8Q6ZV50 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RFX8Q6ZV50 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RFX8Q6ZV50 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RFX8Q6ZV50 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RFX8Q6ZV50 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RFX8Q6ZV50 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RFX8Q6ZV50 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFX8Q6ZV50 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFX8Q6ZV50 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFX8Q6ZV50 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFX8Q6ZV50 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFX8Q6ZV50 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFX8Q6ZV50 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFX8Q6ZV50 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RFX8Q6ZV50 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RFX8Q6ZV50 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RFX8Q6ZV50 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RFX8Q6ZV50 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RFX8Q6ZV50 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RFX8Q6ZV50 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RFX8Q6ZV50 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RFX8Q6ZV50 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RFX8Q6ZV50 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RFX8Q6ZV50 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFX8Q6ZV50 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFX8Q6ZV50 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFX8Q6ZV50 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFX8Q6ZV50 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFX8Q6ZV50 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFX8Q6ZV50 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFX8Q6ZV50 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFX8Q6ZV50 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RFX8Q6ZV50 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFX8Q6ZV50 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFX8Q6ZV50 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFX8Q6ZV50 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFX8Q6ZV50 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFX8Q6ZV50 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFX8Q6ZV50 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFX8Q6ZV50 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFX8Q6ZV50 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFX8Q6ZV50 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFX8Q6ZV50 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFX8Q6ZV50 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFX8Q6ZV50 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX8Q6ZV50 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX8Q6ZV50 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX8Q6ZV50 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX8Q6ZV50 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX8Q6ZV50 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX8Q6ZV50 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX8Q6ZV50 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX8Q6ZV50 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX8Q6ZV50 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
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