Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSG1

RNF165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF165Q6ZSG1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF165Q6ZSG1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF165Q6ZSG1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF165Q6ZSG1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF165Q6ZSG1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF165Q6ZSG1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF165Q6ZSG1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF165Q6ZSG1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF165Q6ZSG1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF165Q6ZSG1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF165Q6ZSG1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF165Q6ZSG1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF165Q6ZSG1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF165Q6ZSG1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF165Q6ZSG1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF165Q6ZSG1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF165Q6ZSG1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF165Q6ZSG1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF165Q6ZSG1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF165Q6ZSG1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF165Q6ZSG1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF165Q6ZSG1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF165Q6ZSG1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF165Q6ZSG1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF165Q6ZSG1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF165Q6ZSG1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF165Q6ZSG1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF165Q6ZSG1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF165Q6ZSG1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF165Q6ZSG1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF165Q6ZSG1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF165Q6ZSG1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF165Q6ZSG1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF165Q6ZSG1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF165Q6ZSG1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF165Q6ZSG1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF165Q6ZSG1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF165Q6ZSG1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF165Q6ZSG1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF165Q6ZSG1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF165Q6ZSG1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF165Q6ZSG1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF165Q6ZSG1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF165Q6ZSG1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF165Q6ZSG1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF165Q6ZSG1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF165Q6ZSG1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF165Q6ZSG1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF165Q6ZSG1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF165Q6ZSG1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF165Q6ZSG1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF165Q6ZSG1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF165Q6ZSG1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF165Q6ZSG1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF165Q6ZSG1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF165Q6ZSG1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF165Q6ZSG1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF165Q6ZSG1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF165Q6ZSG1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF165Q6ZSG1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF165Q6ZSG1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF165Q6ZSG1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF165Q6ZSG1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF165Q6ZSG1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF165Q6ZSG1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF165Q6ZSG1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF165Q6ZSG1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF165Q6ZSG1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF165Q6ZSG1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF165Q6ZSG1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF165Q6ZSG1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF165Q6ZSG1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF165Q6ZSG1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF165Q6ZSG1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF165Q6ZSG1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF165Q6ZSG1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF165Q6ZSG1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF165Q6ZSG1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF165Q6ZSG1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF165Q6ZSG1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF165Q6ZSG1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF165Q6ZSG1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF165Q6ZSG1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF165Q6ZSG1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF165Q6ZSG1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF165Q6ZSG1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF165Q6ZSG1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF165Q6ZSG1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF165Q6ZSG1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF165Q6ZSG1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF165Q6ZSG1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF165Q6ZSG1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF165Q6ZSG1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF165Q6ZSG1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF165Q6ZSG1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF165Q6ZSG1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF165Q6ZSG1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF165Q6ZSG1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF165Q6ZSG1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF165Q6ZSG1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms