Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ38

Cand1, Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cand1Q6ZQ38 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cand1Q6ZQ38 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cand1Q6ZQ38 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cand1Q6ZQ38 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cand1Q6ZQ38 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cand1Q6ZQ38 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cand1Q6ZQ38 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cand1Q6ZQ38 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cand1Q6ZQ38 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cand1Q6ZQ38 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cand1Q6ZQ38 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cand1Q6ZQ38 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cand1Q6ZQ38 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cand1Q6ZQ38 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cand1Q6ZQ38 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cand1Q6ZQ38 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cand1Q6ZQ38 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cand1Q6ZQ38 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cand1Q6ZQ38 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cand1Q6ZQ38 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cand1Q6ZQ38 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cand1Q6ZQ38 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cand1Q6ZQ38 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cand1Q6ZQ38 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cand1Q6ZQ38 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cand1Q6ZQ38 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cand1Q6ZQ38 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cand1Q6ZQ38 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cand1Q6ZQ38 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cand1Q6ZQ38 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cand1Q6ZQ38 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cand1Q6ZQ38 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cand1Q6ZQ38 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cand1Q6ZQ38 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cand1Q6ZQ38 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cand1Q6ZQ38 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cand1Q6ZQ38 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cand1Q6ZQ38 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cand1Q6ZQ38 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cand1Q6ZQ38 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cand1Q6ZQ38 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cand1Q6ZQ38 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cand1Q6ZQ38 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cand1Q6ZQ38 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cand1Q6ZQ38 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cand1Q6ZQ38 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cand1Q6ZQ38 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cand1Q6ZQ38 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cand1Q6ZQ38 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cand1Q6ZQ38 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cand1Q6ZQ38 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cand1Q6ZQ38 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cand1Q6ZQ38 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cand1Q6ZQ38 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cand1Q6ZQ38 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cand1Q6ZQ38 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cand1Q6ZQ38 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cand1Q6ZQ38 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cand1Q6ZQ38 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cand1Q6ZQ38 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cand1Q6ZQ38 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cand1Q6ZQ38 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cand1Q6ZQ38 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cand1Q6ZQ38 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cand1Q6ZQ38 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cand1Q6ZQ38 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cand1Q6ZQ38 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cand1Q6ZQ38 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cand1Q6ZQ38 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cand1Q6ZQ38 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cand1Q6ZQ38 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cand1Q6ZQ38 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cand1Q6ZQ38 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cand1Q6ZQ38 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cand1Q6ZQ38 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cand1Q6ZQ38 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cand1Q6ZQ38 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cand1Q6ZQ38 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cand1Q6ZQ38 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cand1Q6ZQ38 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cand1Q6ZQ38 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cand1Q6ZQ38 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cand1Q6ZQ38 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cand1Q6ZQ38 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cand1Q6ZQ38 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cand1Q6ZQ38 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cand1Q6ZQ38 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cand1Q6ZQ38 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cand1Q6ZQ38 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cand1Q6ZQ38 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cand1Q6ZQ38 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cand1Q6ZQ38 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cand1Q6ZQ38 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cand1Q6ZQ38 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cand1Q6ZQ38 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cand1Q6ZQ38 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cand1Q6ZQ38 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cand1Q6ZQ38 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cand1Q6ZQ38 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cand1Q6ZQ38 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 204.9 ms