Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GBP6Q6ZN66 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GBP6Q6ZN66 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GBP6Q6ZN66 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GBP6Q6ZN66 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
GBP6Q6ZN66 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GBP6Q6ZN66 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GBP6Q6ZN66 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GBP6Q6ZN66 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GBP6Q6ZN66 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GBP6Q6ZN66 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GBP6Q6ZN66 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GBP6Q6ZN66 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GBP6Q6ZN66 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GBP6Q6ZN66 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GBP6Q6ZN66 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GBP6Q6ZN66 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GBP6Q6ZN66 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GBP6Q6ZN66 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GBP6Q6ZN66 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GBP6Q6ZN66 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GBP6Q6ZN66 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GBP6Q6ZN66 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GBP6Q6ZN66 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GBP6Q6ZN66 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GBP6Q6ZN66 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GBP6Q6ZN66 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GBP6Q6ZN66 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GBP6Q6ZN66 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GBP6Q6ZN66 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GBP6Q6ZN66 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GBP6Q6ZN66 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GBP6Q6ZN66 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GBP6Q6ZN66 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GBP6Q6ZN66 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GBP6Q6ZN66 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GBP6Q6ZN66 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GBP6Q6ZN66 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GBP6Q6ZN66 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GBP6Q6ZN66 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GBP6Q6ZN66 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GBP6Q6ZN66 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GBP6Q6ZN66 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GBP6Q6ZN66 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GBP6Q6ZN66 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GBP6Q6ZN66 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GBP6Q6ZN66 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GBP6Q6ZN66 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GBP6Q6ZN66 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GBP6Q6ZN66 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GBP6Q6ZN66 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GBP6Q6ZN66 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GBP6Q6ZN66 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GBP6Q6ZN66 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GBP6Q6ZN66 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GBP6Q6ZN66 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GBP6Q6ZN66 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GBP6Q6ZN66 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GBP6Q6ZN66 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GBP6Q6ZN66 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GBP6Q6ZN66 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GBP6Q6ZN66 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GBP6Q6ZN66 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GBP6Q6ZN66 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GBP6Q6ZN66 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GBP6Q6ZN66 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GBP6Q6ZN66 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GBP6Q6ZN66 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GBP6Q6ZN66 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GBP6Q6ZN66 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GBP6Q6ZN66 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GBP6Q6ZN66 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GBP6Q6ZN66 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GBP6Q6ZN66 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GBP6Q6ZN66 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GBP6Q6ZN66 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GBP6Q6ZN66 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GBP6Q6ZN66 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GBP6Q6ZN66 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GBP6Q6ZN66 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GBP6Q6ZN66 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GBP6Q6ZN66 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GBP6Q6ZN66 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GBP6Q6ZN66 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GBP6Q6ZN66 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GBP6Q6ZN66 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GBP6Q6ZN66 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GBP6Q6ZN66 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GBP6Q6ZN66 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GBP6Q6ZN66 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GBP6Q6ZN66 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GBP6Q6ZN66 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GBP6Q6ZN66 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GBP6Q6ZN66 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GBP6Q6ZN66 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GBP6Q6ZN66 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GBP6Q6ZN66 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GBP6Q6ZN66 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GBP6Q6ZN66 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GBP6Q6ZN66 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms