Protein–RNA interactions for Protein: Q6XD76

ASCL4, Achaete-scute homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL4Q6XD76 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ASCL4Q6XD76 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ASCL4Q6XD76 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ASCL4Q6XD76 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ASCL4Q6XD76 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ASCL4Q6XD76 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ASCL4Q6XD76 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ASCL4Q6XD76 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ASCL4Q6XD76 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ASCL4Q6XD76 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ASCL4Q6XD76 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ASCL4Q6XD76 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ASCL4Q6XD76 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ASCL4Q6XD76 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ASCL4Q6XD76 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ASCL4Q6XD76 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ASCL4Q6XD76 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ASCL4Q6XD76 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ASCL4Q6XD76 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ASCL4Q6XD76 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ASCL4Q6XD76 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ASCL4Q6XD76 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ASCL4Q6XD76 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ASCL4Q6XD76 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ASCL4Q6XD76 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ASCL4Q6XD76 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ASCL4Q6XD76 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ASCL4Q6XD76 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ASCL4Q6XD76 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASCL4Q6XD76 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASCL4Q6XD76 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASCL4Q6XD76 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASCL4Q6XD76 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ASCL4Q6XD76 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASCL4Q6XD76 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASCL4Q6XD76 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASCL4Q6XD76 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASCL4Q6XD76 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASCL4Q6XD76 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASCL4Q6XD76 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASCL4Q6XD76 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASCL4Q6XD76 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASCL4Q6XD76 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASCL4Q6XD76 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASCL4Q6XD76 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASCL4Q6XD76 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ASCL4Q6XD76 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASCL4Q6XD76 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASCL4Q6XD76 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASCL4Q6XD76 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ASCL4Q6XD76 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASCL4Q6XD76 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASCL4Q6XD76 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASCL4Q6XD76 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASCL4Q6XD76 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASCL4Q6XD76 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASCL4Q6XD76 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASCL4Q6XD76 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASCL4Q6XD76 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ASCL4Q6XD76 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ASCL4Q6XD76 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ASCL4Q6XD76 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ASCL4Q6XD76 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ASCL4Q6XD76 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ASCL4Q6XD76 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ASCL4Q6XD76 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASCL4Q6XD76 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASCL4Q6XD76 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASCL4Q6XD76 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASCL4Q6XD76 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASCL4Q6XD76 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASCL4Q6XD76 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASCL4Q6XD76 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASCL4Q6XD76 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASCL4Q6XD76 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ASCL4Q6XD76 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASCL4Q6XD76 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASCL4Q6XD76 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASCL4Q6XD76 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ASCL4Q6XD76 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ASCL4Q6XD76 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ASCL4Q6XD76 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ASCL4Q6XD76 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ASCL4Q6XD76 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ASCL4Q6XD76 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ASCL4Q6XD76 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ASCL4Q6XD76 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ASCL4Q6XD76 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ASCL4Q6XD76 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ASCL4Q6XD76 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ASCL4Q6XD76 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ASCL4Q6XD76 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ASCL4Q6XD76 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ASCL4Q6XD76 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ASCL4Q6XD76 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ASCL4Q6XD76 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ASCL4Q6XD76 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ASCL4Q6XD76 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ASCL4Q6XD76 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ASCL4Q6XD76 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms