Protein–RNA interactions for Protein: Q6W4X9

MUC6, Mucin-6, humanhuman

Predictions only

Length 2,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC6Q6W4X9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MUC6Q6W4X9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MUC6Q6W4X9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MUC6Q6W4X9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MUC6Q6W4X9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MUC6Q6W4X9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MUC6Q6W4X9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MUC6Q6W4X9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MUC6Q6W4X9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MUC6Q6W4X9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MUC6Q6W4X9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MUC6Q6W4X9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
MUC6Q6W4X9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MUC6Q6W4X9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MUC6Q6W4X9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MUC6Q6W4X9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MUC6Q6W4X9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MUC6Q6W4X9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MUC6Q6W4X9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MUC6Q6W4X9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MUC6Q6W4X9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MUC6Q6W4X9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MUC6Q6W4X9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MUC6Q6W4X9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MUC6Q6W4X9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MUC6Q6W4X9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MUC6Q6W4X9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MUC6Q6W4X9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MUC6Q6W4X9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MUC6Q6W4X9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MUC6Q6W4X9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MUC6Q6W4X9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MUC6Q6W4X9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MUC6Q6W4X9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MUC6Q6W4X9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MUC6Q6W4X9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MUC6Q6W4X9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MUC6Q6W4X9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MUC6Q6W4X9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MUC6Q6W4X9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MUC6Q6W4X9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MUC6Q6W4X9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MUC6Q6W4X9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MUC6Q6W4X9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MUC6Q6W4X9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MUC6Q6W4X9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MUC6Q6W4X9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MUC6Q6W4X9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MUC6Q6W4X9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MUC6Q6W4X9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MUC6Q6W4X9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MUC6Q6W4X9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MUC6Q6W4X9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MUC6Q6W4X9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MUC6Q6W4X9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MUC6Q6W4X9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MUC6Q6W4X9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MUC6Q6W4X9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MUC6Q6W4X9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MUC6Q6W4X9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MUC6Q6W4X9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MUC6Q6W4X9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MUC6Q6W4X9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MUC6Q6W4X9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MUC6Q6W4X9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MUC6Q6W4X9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MUC6Q6W4X9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MUC6Q6W4X9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MUC6Q6W4X9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MUC6Q6W4X9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MUC6Q6W4X9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MUC6Q6W4X9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MUC6Q6W4X9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MUC6Q6W4X9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MUC6Q6W4X9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MUC6Q6W4X9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MUC6Q6W4X9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MUC6Q6W4X9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MUC6Q6W4X9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MUC6Q6W4X9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MUC6Q6W4X9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MUC6Q6W4X9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MUC6Q6W4X9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MUC6Q6W4X9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MUC6Q6W4X9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MUC6Q6W4X9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MUC6Q6W4X9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MUC6Q6W4X9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MUC6Q6W4X9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MUC6Q6W4X9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MUC6Q6W4X9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MUC6Q6W4X9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MUC6Q6W4X9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MUC6Q6W4X9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MUC6Q6W4X9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MUC6Q6W4X9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MUC6Q6W4X9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MUC6Q6W4X9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MUC6Q6W4X9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MUC6Q6W4X9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms