Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCBE1Q6UXH8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCBE1Q6UXH8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCBE1Q6UXH8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCBE1Q6UXH8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCBE1Q6UXH8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCBE1Q6UXH8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCBE1Q6UXH8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCBE1Q6UXH8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCBE1Q6UXH8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCBE1Q6UXH8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCBE1Q6UXH8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCBE1Q6UXH8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCBE1Q6UXH8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCBE1Q6UXH8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCBE1Q6UXH8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCBE1Q6UXH8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCBE1Q6UXH8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCBE1Q6UXH8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCBE1Q6UXH8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCBE1Q6UXH8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCBE1Q6UXH8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCBE1Q6UXH8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCBE1Q6UXH8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCBE1Q6UXH8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCBE1Q6UXH8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCBE1Q6UXH8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCBE1Q6UXH8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCBE1Q6UXH8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCBE1Q6UXH8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCBE1Q6UXH8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCBE1Q6UXH8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCBE1Q6UXH8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCBE1Q6UXH8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCBE1Q6UXH8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCBE1Q6UXH8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCBE1Q6UXH8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCBE1Q6UXH8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCBE1Q6UXH8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCBE1Q6UXH8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCBE1Q6UXH8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCBE1Q6UXH8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCBE1Q6UXH8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCBE1Q6UXH8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCBE1Q6UXH8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCBE1Q6UXH8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCBE1Q6UXH8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCBE1Q6UXH8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCBE1Q6UXH8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCBE1Q6UXH8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCBE1Q6UXH8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCBE1Q6UXH8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCBE1Q6UXH8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCBE1Q6UXH8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCBE1Q6UXH8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCBE1Q6UXH8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCBE1Q6UXH8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCBE1Q6UXH8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCBE1Q6UXH8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCBE1Q6UXH8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCBE1Q6UXH8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCBE1Q6UXH8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCBE1Q6UXH8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCBE1Q6UXH8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCBE1Q6UXH8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCBE1Q6UXH8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCBE1Q6UXH8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCBE1Q6UXH8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCBE1Q6UXH8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCBE1Q6UXH8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCBE1Q6UXH8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCBE1Q6UXH8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCBE1Q6UXH8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCBE1Q6UXH8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCBE1Q6UXH8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCBE1Q6UXH8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCBE1Q6UXH8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCBE1Q6UXH8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCBE1Q6UXH8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCBE1Q6UXH8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCBE1Q6UXH8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCBE1Q6UXH8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCBE1Q6UXH8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCBE1Q6UXH8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCBE1Q6UXH8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCBE1Q6UXH8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCBE1Q6UXH8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCBE1Q6UXH8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCBE1Q6UXH8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCBE1Q6UXH8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCBE1Q6UXH8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCBE1Q6UXH8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCBE1Q6UXH8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCBE1Q6UXH8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCBE1Q6UXH8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCBE1Q6UXH8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCBE1Q6UXH8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCBE1Q6UXH8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCBE1Q6UXH8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCBE1Q6UXH8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms