Protein–RNA interactions for Protein: Q6SPF0

SAMD1, Atherin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1Q6SPF0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SAMD1Q6SPF0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SAMD1Q6SPF0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SAMD1Q6SPF0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SAMD1Q6SPF0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SAMD1Q6SPF0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SAMD1Q6SPF0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SAMD1Q6SPF0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SAMD1Q6SPF0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SAMD1Q6SPF0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SAMD1Q6SPF0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SAMD1Q6SPF0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SAMD1Q6SPF0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SAMD1Q6SPF0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SAMD1Q6SPF0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SAMD1Q6SPF0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SAMD1Q6SPF0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SAMD1Q6SPF0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SAMD1Q6SPF0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SAMD1Q6SPF0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SAMD1Q6SPF0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SAMD1Q6SPF0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SAMD1Q6SPF0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SAMD1Q6SPF0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SAMD1Q6SPF0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SAMD1Q6SPF0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SAMD1Q6SPF0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SAMD1Q6SPF0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SAMD1Q6SPF0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SAMD1Q6SPF0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SAMD1Q6SPF0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SAMD1Q6SPF0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SAMD1Q6SPF0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SAMD1Q6SPF0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SAMD1Q6SPF0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SAMD1Q6SPF0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SAMD1Q6SPF0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SAMD1Q6SPF0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SAMD1Q6SPF0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SAMD1Q6SPF0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SAMD1Q6SPF0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SAMD1Q6SPF0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SAMD1Q6SPF0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SAMD1Q6SPF0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SAMD1Q6SPF0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SAMD1Q6SPF0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SAMD1Q6SPF0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SAMD1Q6SPF0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SAMD1Q6SPF0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SAMD1Q6SPF0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SAMD1Q6SPF0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SAMD1Q6SPF0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SAMD1Q6SPF0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SAMD1Q6SPF0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SAMD1Q6SPF0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SAMD1Q6SPF0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SAMD1Q6SPF0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SAMD1Q6SPF0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SAMD1Q6SPF0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SAMD1Q6SPF0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SAMD1Q6SPF0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SAMD1Q6SPF0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SAMD1Q6SPF0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SAMD1Q6SPF0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SAMD1Q6SPF0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SAMD1Q6SPF0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SAMD1Q6SPF0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SAMD1Q6SPF0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SAMD1Q6SPF0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SAMD1Q6SPF0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SAMD1Q6SPF0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SAMD1Q6SPF0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SAMD1Q6SPF0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SAMD1Q6SPF0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SAMD1Q6SPF0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SAMD1Q6SPF0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SAMD1Q6SPF0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SAMD1Q6SPF0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SAMD1Q6SPF0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SAMD1Q6SPF0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SAMD1Q6SPF0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SAMD1Q6SPF0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SAMD1Q6SPF0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SAMD1Q6SPF0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SAMD1Q6SPF0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SAMD1Q6SPF0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
SAMD1Q6SPF0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SAMD1Q6SPF0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SAMD1Q6SPF0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SAMD1Q6SPF0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SAMD1Q6SPF0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SAMD1Q6SPF0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SAMD1Q6SPF0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SAMD1Q6SPF0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SAMD1Q6SPF0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SAMD1Q6SPF0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SAMD1Q6SPF0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SAMD1Q6SPF0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SAMD1Q6SPF0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SAMD1Q6SPF0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139 ms