Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ5

Cd300ld3, CMRF35-like molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld3Q6SJQ5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd300ld3Q6SJQ5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd300ld3Q6SJQ5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd300ld3Q6SJQ5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd300ld3Q6SJQ5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd300ld3Q6SJQ5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd300ld3Q6SJQ5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd300ld3Q6SJQ5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd300ld3Q6SJQ5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd300ld3Q6SJQ5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cd300ld3Q6SJQ5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cd300ld3Q6SJQ5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cd300ld3Q6SJQ5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cd300ld3Q6SJQ5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd300ld3Q6SJQ5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd300ld3Q6SJQ5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd300ld3Q6SJQ5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd300ld3Q6SJQ5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd300ld3Q6SJQ5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd300ld3Q6SJQ5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd300ld3Q6SJQ5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd300ld3Q6SJQ5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd300ld3Q6SJQ5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd300ld3Q6SJQ5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd300ld3Q6SJQ5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd300ld3Q6SJQ5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd300ld3Q6SJQ5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd300ld3Q6SJQ5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd300ld3Q6SJQ5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd300ld3Q6SJQ5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd300ld3Q6SJQ5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300ld3Q6SJQ5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300ld3Q6SJQ5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300ld3Q6SJQ5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300ld3Q6SJQ5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300ld3Q6SJQ5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300ld3Q6SJQ5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300ld3Q6SJQ5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300ld3Q6SJQ5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd300ld3Q6SJQ5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd300ld3Q6SJQ5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd300ld3Q6SJQ5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cd300ld3Q6SJQ5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd300ld3Q6SJQ5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd300ld3Q6SJQ5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd300ld3Q6SJQ5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd300ld3Q6SJQ5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd300ld3Q6SJQ5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd300ld3Q6SJQ5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd300ld3Q6SJQ5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd300ld3Q6SJQ5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd300ld3Q6SJQ5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd300ld3Q6SJQ5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd300ld3Q6SJQ5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300ld3Q6SJQ5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300ld3Q6SJQ5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300ld3Q6SJQ5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300ld3Q6SJQ5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300ld3Q6SJQ5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300ld3Q6SJQ5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300ld3Q6SJQ5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300ld3Q6SJQ5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300ld3Q6SJQ5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd300ld3Q6SJQ5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd300ld3Q6SJQ5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd300ld3Q6SJQ5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd300ld3Q6SJQ5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd300ld3Q6SJQ5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd300ld3Q6SJQ5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd300ld3Q6SJQ5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd300ld3Q6SJQ5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd300ld3Q6SJQ5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd300ld3Q6SJQ5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd300ld3Q6SJQ5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd300ld3Q6SJQ5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd300ld3Q6SJQ5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd300ld3Q6SJQ5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd300ld3Q6SJQ5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd300ld3Q6SJQ5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd300ld3Q6SJQ5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd300ld3Q6SJQ5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd300ld3Q6SJQ5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd300ld3Q6SJQ5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd300ld3Q6SJQ5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms