Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gja6Q6S5G4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gja6Q6S5G4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gja6Q6S5G4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gja6Q6S5G4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gja6Q6S5G4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gja6Q6S5G4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gja6Q6S5G4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gja6Q6S5G4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gja6Q6S5G4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gja6Q6S5G4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gja6Q6S5G4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gja6Q6S5G4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gja6Q6S5G4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gja6Q6S5G4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gja6Q6S5G4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gja6Q6S5G4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gja6Q6S5G4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gja6Q6S5G4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gja6Q6S5G4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gja6Q6S5G4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gja6Q6S5G4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gja6Q6S5G4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gja6Q6S5G4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gja6Q6S5G4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gja6Q6S5G4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gja6Q6S5G4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gja6Q6S5G4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gja6Q6S5G4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gja6Q6S5G4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Gja6Q6S5G4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gja6Q6S5G4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gja6Q6S5G4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gja6Q6S5G4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gja6Q6S5G4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gja6Q6S5G4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gja6Q6S5G4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gja6Q6S5G4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gja6Q6S5G4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gja6Q6S5G4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gja6Q6S5G4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Gja6Q6S5G4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
Gja6Q6S5G4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Gja6Q6S5G4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gja6Q6S5G4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gja6Q6S5G4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gja6Q6S5G4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Gja6Q6S5G4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gja6Q6S5G4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Gja6Q6S5G4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gja6Q6S5G4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gja6Q6S5G4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gja6Q6S5G4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gja6Q6S5G4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gja6Q6S5G4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gja6Q6S5G4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gja6Q6S5G4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gja6Q6S5G4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gja6Q6S5G4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gja6Q6S5G4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gja6Q6S5G4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gja6Q6S5G4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gja6Q6S5G4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gja6Q6S5G4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gja6Q6S5G4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gja6Q6S5G4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gja6Q6S5G4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gja6Q6S5G4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gja6Q6S5G4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gja6Q6S5G4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gja6Q6S5G4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gja6Q6S5G4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gja6Q6S5G4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gja6Q6S5G4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gja6Q6S5G4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gja6Q6S5G4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gja6Q6S5G4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gja6Q6S5G4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gja6Q6S5G4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gja6Q6S5G4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gja6Q6S5G4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gja6Q6S5G4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gja6Q6S5G4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gja6Q6S5G4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Gja6Q6S5G4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gja6Q6S5G4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gja6Q6S5G4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gja6Q6S5G4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gja6Q6S5G4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Gja6Q6S5G4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gja6Q6S5G4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gja6Q6S5G4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gja6Q6S5G4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gja6Q6S5G4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gja6Q6S5G4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gja6Q6S5G4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Gja6Q6S5G4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gja6Q6S5G4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gja6Q6S5G4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gja6Q6S5G4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms