Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRIP3Q6Q6R5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRIP3Q6Q6R5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRIP3Q6Q6R5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRIP3Q6Q6R5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRIP3Q6Q6R5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CRIP3Q6Q6R5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CRIP3Q6Q6R5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CRIP3Q6Q6R5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CRIP3Q6Q6R5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CRIP3Q6Q6R5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CRIP3Q6Q6R5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CRIP3Q6Q6R5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CRIP3Q6Q6R5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CRIP3Q6Q6R5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CRIP3Q6Q6R5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CRIP3Q6Q6R5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CRIP3Q6Q6R5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CRIP3Q6Q6R5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CRIP3Q6Q6R5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CRIP3Q6Q6R5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CRIP3Q6Q6R5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CRIP3Q6Q6R5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CRIP3Q6Q6R5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CRIP3Q6Q6R5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CRIP3Q6Q6R5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CRIP3Q6Q6R5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CRIP3Q6Q6R5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CRIP3Q6Q6R5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CRIP3Q6Q6R5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CRIP3Q6Q6R5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CRIP3Q6Q6R5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CRIP3Q6Q6R5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CRIP3Q6Q6R5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CRIP3Q6Q6R5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CRIP3Q6Q6R5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CRIP3Q6Q6R5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CRIP3Q6Q6R5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CRIP3Q6Q6R5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CRIP3Q6Q6R5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CRIP3Q6Q6R5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CRIP3Q6Q6R5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CRIP3Q6Q6R5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CRIP3Q6Q6R5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRIP3Q6Q6R5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CRIP3Q6Q6R5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRIP3Q6Q6R5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRIP3Q6Q6R5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CRIP3Q6Q6R5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRIP3Q6Q6R5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRIP3Q6Q6R5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRIP3Q6Q6R5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRIP3Q6Q6R5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRIP3Q6Q6R5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRIP3Q6Q6R5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRIP3Q6Q6R5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRIP3Q6Q6R5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRIP3Q6Q6R5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRIP3Q6Q6R5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRIP3Q6Q6R5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRIP3Q6Q6R5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRIP3Q6Q6R5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CRIP3Q6Q6R5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRIP3Q6Q6R5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRIP3Q6Q6R5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRIP3Q6Q6R5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRIP3Q6Q6R5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRIP3Q6Q6R5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRIP3Q6Q6R5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRIP3Q6Q6R5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRIP3Q6Q6R5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRIP3Q6Q6R5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRIP3Q6Q6R5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRIP3Q6Q6R5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRIP3Q6Q6R5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRIP3Q6Q6R5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRIP3Q6Q6R5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRIP3Q6Q6R5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRIP3Q6Q6R5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRIP3Q6Q6R5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRIP3Q6Q6R5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRIP3Q6Q6R5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRIP3Q6Q6R5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRIP3Q6Q6R5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRIP3Q6Q6R5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRIP3Q6Q6R5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRIP3Q6Q6R5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CRIP3Q6Q6R5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CRIP3Q6Q6R5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CRIP3Q6Q6R5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRIP3Q6Q6R5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CRIP3Q6Q6R5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRIP3Q6Q6R5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRIP3Q6Q6R5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRIP3Q6Q6R5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRIP3Q6Q6R5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRIP3Q6Q6R5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRIP3Q6Q6R5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRIP3Q6Q6R5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRIP3Q6Q6R5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms