Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC137Q6PK04 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC137Q6PK04 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC137Q6PK04 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC137Q6PK04 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC137Q6PK04 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC137Q6PK04 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC137Q6PK04 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC137Q6PK04 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC137Q6PK04 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC137Q6PK04 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC137Q6PK04 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC137Q6PK04 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC137Q6PK04 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC137Q6PK04 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC137Q6PK04 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC137Q6PK04 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC137Q6PK04 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC137Q6PK04 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC137Q6PK04 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC137Q6PK04 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC137Q6PK04 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC137Q6PK04 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC137Q6PK04 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC137Q6PK04 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC137Q6PK04 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC137Q6PK04 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC137Q6PK04 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC137Q6PK04 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC137Q6PK04 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC137Q6PK04 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC137Q6PK04 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC137Q6PK04 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC137Q6PK04 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC137Q6PK04 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC137Q6PK04 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC137Q6PK04 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC137Q6PK04 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC137Q6PK04 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC137Q6PK04 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC137Q6PK04 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC137Q6PK04 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC137Q6PK04 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC137Q6PK04 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC137Q6PK04 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC137Q6PK04 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC137Q6PK04 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC137Q6PK04 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC137Q6PK04 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC137Q6PK04 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC137Q6PK04 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC137Q6PK04 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC137Q6PK04 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC137Q6PK04 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC137Q6PK04 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC137Q6PK04 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC137Q6PK04 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC137Q6PK04 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC137Q6PK04 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC137Q6PK04 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC137Q6PK04 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC137Q6PK04 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC137Q6PK04 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC137Q6PK04 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC137Q6PK04 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC137Q6PK04 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC137Q6PK04 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC137Q6PK04 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC137Q6PK04 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC137Q6PK04 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC137Q6PK04 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC137Q6PK04 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC137Q6PK04 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC137Q6PK04 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC137Q6PK04 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC137Q6PK04 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC137Q6PK04 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC137Q6PK04 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC137Q6PK04 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC137Q6PK04 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC137Q6PK04 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC137Q6PK04 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC137Q6PK04 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC137Q6PK04 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC137Q6PK04 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC137Q6PK04 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC137Q6PK04 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC137Q6PK04 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC137Q6PK04 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC137Q6PK04 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC137Q6PK04 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC137Q6PK04 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC137Q6PK04 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC137Q6PK04 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC137Q6PK04 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC137Q6PK04 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC137Q6PK04 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC137Q6PK04 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC137Q6PK04 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC137Q6PK04 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms