Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Chd4Q6PDQ2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Chd4Q6PDQ2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Chd4Q6PDQ2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Chd4Q6PDQ2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Chd4Q6PDQ2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Chd4Q6PDQ2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Chd4Q6PDQ2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Chd4Q6PDQ2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Chd4Q6PDQ2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Chd4Q6PDQ2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Chd4Q6PDQ2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Chd4Q6PDQ2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Chd4Q6PDQ2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Chd4Q6PDQ2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Chd4Q6PDQ2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Chd4Q6PDQ2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Chd4Q6PDQ2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Chd4Q6PDQ2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Chd4Q6PDQ2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Chd4Q6PDQ2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Chd4Q6PDQ2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Chd4Q6PDQ2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Chd4Q6PDQ2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Chd4Q6PDQ2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Chd4Q6PDQ2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Chd4Q6PDQ2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Chd4Q6PDQ2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Chd4Q6PDQ2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Chd4Q6PDQ2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Chd4Q6PDQ2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Chd4Q6PDQ2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Chd4Q6PDQ2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Chd4Q6PDQ2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Chd4Q6PDQ2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Chd4Q6PDQ2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Chd4Q6PDQ2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Chd4Q6PDQ2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Chd4Q6PDQ2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Chd4Q6PDQ2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Chd4Q6PDQ2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Chd4Q6PDQ2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Chd4Q6PDQ2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Chd4Q6PDQ2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Chd4Q6PDQ2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Chd4Q6PDQ2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Chd4Q6PDQ2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Chd4Q6PDQ2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Chd4Q6PDQ2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Chd4Q6PDQ2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Chd4Q6PDQ2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Chd4Q6PDQ2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Chd4Q6PDQ2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Chd4Q6PDQ2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Chd4Q6PDQ2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Chd4Q6PDQ2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Chd4Q6PDQ2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Chd4Q6PDQ2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Chd4Q6PDQ2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Chd4Q6PDQ2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Chd4Q6PDQ2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Chd4Q6PDQ2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Chd4Q6PDQ2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Chd4Q6PDQ2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Chd4Q6PDQ2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Chd4Q6PDQ2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Chd4Q6PDQ2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Chd4Q6PDQ2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Chd4Q6PDQ2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Chd4Q6PDQ2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Chd4Q6PDQ2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Chd4Q6PDQ2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Chd4Q6PDQ2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Chd4Q6PDQ2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Chd4Q6PDQ2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Chd4Q6PDQ2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Chd4Q6PDQ2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Chd4Q6PDQ2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Chd4Q6PDQ2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Chd4Q6PDQ2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Chd4Q6PDQ2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Chd4Q6PDQ2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Chd4Q6PDQ2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Chd4Q6PDQ2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Chd4Q6PDQ2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Chd4Q6PDQ2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Chd4Q6PDQ2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Chd4Q6PDQ2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Chd4Q6PDQ2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Chd4Q6PDQ2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Chd4Q6PDQ2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Chd4Q6PDQ2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Chd4Q6PDQ2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Chd4Q6PDQ2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Chd4Q6PDQ2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Chd4Q6PDQ2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Chd4Q6PDQ2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Chd4Q6PDQ2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Chd4Q6PDQ2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Chd4Q6PDQ2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms