Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDN3

Mylk, Myosin light chain kinase, smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MylkQ6PDN3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MylkQ6PDN3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MylkQ6PDN3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MylkQ6PDN3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MylkQ6PDN3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MylkQ6PDN3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MylkQ6PDN3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MylkQ6PDN3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MylkQ6PDN3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MylkQ6PDN3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MylkQ6PDN3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MylkQ6PDN3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MylkQ6PDN3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MylkQ6PDN3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MylkQ6PDN3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MylkQ6PDN3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MylkQ6PDN3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MylkQ6PDN3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MylkQ6PDN3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MylkQ6PDN3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MylkQ6PDN3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MylkQ6PDN3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MylkQ6PDN3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MylkQ6PDN3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MylkQ6PDN3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MylkQ6PDN3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MylkQ6PDN3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MylkQ6PDN3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MylkQ6PDN3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MylkQ6PDN3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MylkQ6PDN3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MylkQ6PDN3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MylkQ6PDN3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MylkQ6PDN3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MylkQ6PDN3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MylkQ6PDN3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MylkQ6PDN3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MylkQ6PDN3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MylkQ6PDN3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MylkQ6PDN3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MylkQ6PDN3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MylkQ6PDN3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MylkQ6PDN3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MylkQ6PDN3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MylkQ6PDN3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MylkQ6PDN3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MylkQ6PDN3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MylkQ6PDN3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MylkQ6PDN3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MylkQ6PDN3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MylkQ6PDN3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MylkQ6PDN3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MylkQ6PDN3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MylkQ6PDN3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MylkQ6PDN3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MylkQ6PDN3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MylkQ6PDN3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MylkQ6PDN3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MylkQ6PDN3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MylkQ6PDN3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MylkQ6PDN3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MylkQ6PDN3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MylkQ6PDN3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MylkQ6PDN3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MylkQ6PDN3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MylkQ6PDN3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MylkQ6PDN3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MylkQ6PDN3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MylkQ6PDN3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MylkQ6PDN3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MylkQ6PDN3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MylkQ6PDN3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MylkQ6PDN3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MylkQ6PDN3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MylkQ6PDN3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MylkQ6PDN3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MylkQ6PDN3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MylkQ6PDN3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MylkQ6PDN3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MylkQ6PDN3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MylkQ6PDN3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MylkQ6PDN3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MylkQ6PDN3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MylkQ6PDN3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MylkQ6PDN3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MylkQ6PDN3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MylkQ6PDN3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MylkQ6PDN3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MylkQ6PDN3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MylkQ6PDN3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MylkQ6PDN3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MylkQ6PDN3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MylkQ6PDN3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MylkQ6PDN3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MylkQ6PDN3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MylkQ6PDN3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MylkQ6PDN3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MylkQ6PDN3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MylkQ6PDN3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MylkQ6PDN3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms