Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bhlhb9Q6PB60 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bhlhb9Q6PB60 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bhlhb9Q6PB60 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Bhlhb9Q6PB60 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bhlhb9Q6PB60 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bhlhb9Q6PB60 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bhlhb9Q6PB60 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Bhlhb9Q6PB60 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bhlhb9Q6PB60 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bhlhb9Q6PB60 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bhlhb9Q6PB60 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Bhlhb9Q6PB60 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bhlhb9Q6PB60 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bhlhb9Q6PB60 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bhlhb9Q6PB60 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bhlhb9Q6PB60 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Bhlhb9Q6PB60 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bhlhb9Q6PB60 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bhlhb9Q6PB60 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bhlhb9Q6PB60 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bhlhb9Q6PB60 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bhlhb9Q6PB60 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bhlhb9Q6PB60 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bhlhb9Q6PB60 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bhlhb9Q6PB60 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bhlhb9Q6PB60 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bhlhb9Q6PB60 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bhlhb9Q6PB60 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bhlhb9Q6PB60 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bhlhb9Q6PB60 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bhlhb9Q6PB60 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bhlhb9Q6PB60 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bhlhb9Q6PB60 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bhlhb9Q6PB60 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bhlhb9Q6PB60 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Bhlhb9Q6PB60 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bhlhb9Q6PB60 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bhlhb9Q6PB60 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bhlhb9Q6PB60 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bhlhb9Q6PB60 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bhlhb9Q6PB60 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bhlhb9Q6PB60 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bhlhb9Q6PB60 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bhlhb9Q6PB60 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bhlhb9Q6PB60 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bhlhb9Q6PB60 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bhlhb9Q6PB60 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bhlhb9Q6PB60 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bhlhb9Q6PB60 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bhlhb9Q6PB60 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bhlhb9Q6PB60 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bhlhb9Q6PB60 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bhlhb9Q6PB60 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bhlhb9Q6PB60 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bhlhb9Q6PB60 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bhlhb9Q6PB60 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bhlhb9Q6PB60 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bhlhb9Q6PB60 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bhlhb9Q6PB60 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bhlhb9Q6PB60 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bhlhb9Q6PB60 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bhlhb9Q6PB60 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bhlhb9Q6PB60 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bhlhb9Q6PB60 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bhlhb9Q6PB60 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bhlhb9Q6PB60 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bhlhb9Q6PB60 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bhlhb9Q6PB60 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bhlhb9Q6PB60 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bhlhb9Q6PB60 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bhlhb9Q6PB60 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bhlhb9Q6PB60 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bhlhb9Q6PB60 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bhlhb9Q6PB60 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bhlhb9Q6PB60 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bhlhb9Q6PB60 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bhlhb9Q6PB60 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bhlhb9Q6PB60 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bhlhb9Q6PB60 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bhlhb9Q6PB60 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bhlhb9Q6PB60 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bhlhb9Q6PB60 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bhlhb9Q6PB60 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bhlhb9Q6PB60 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bhlhb9Q6PB60 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bhlhb9Q6PB60 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Bhlhb9Q6PB60 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bhlhb9Q6PB60 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bhlhb9Q6PB60 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bhlhb9Q6PB60 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bhlhb9Q6PB60 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bhlhb9Q6PB60 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bhlhb9Q6PB60 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bhlhb9Q6PB60 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bhlhb9Q6PB60 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Bhlhb9Q6PB60 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bhlhb9Q6PB60 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Bhlhb9Q6PB60 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bhlhb9Q6PB60 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms