Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cyp2d40Q6P8N9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cyp2d40Q6P8N9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cyp2d40Q6P8N9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cyp2d40Q6P8N9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cyp2d40Q6P8N9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cyp2d40Q6P8N9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cyp2d40Q6P8N9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cyp2d40Q6P8N9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cyp2d40Q6P8N9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cyp2d40Q6P8N9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cyp2d40Q6P8N9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cyp2d40Q6P8N9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cyp2d40Q6P8N9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cyp2d40Q6P8N9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cyp2d40Q6P8N9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cyp2d40Q6P8N9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cyp2d40Q6P8N9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cyp2d40Q6P8N9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cyp2d40Q6P8N9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cyp2d40Q6P8N9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cyp2d40Q6P8N9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cyp2d40Q6P8N9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cyp2d40Q6P8N9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cyp2d40Q6P8N9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cyp2d40Q6P8N9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cyp2d40Q6P8N9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cyp2d40Q6P8N9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cyp2d40Q6P8N9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cyp2d40Q6P8N9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cyp2d40Q6P8N9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cyp2d40Q6P8N9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cyp2d40Q6P8N9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cyp2d40Q6P8N9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cyp2d40Q6P8N9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cyp2d40Q6P8N9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cyp2d40Q6P8N9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cyp2d40Q6P8N9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cyp2d40Q6P8N9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cyp2d40Q6P8N9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cyp2d40Q6P8N9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cyp2d40Q6P8N9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cyp2d40Q6P8N9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cyp2d40Q6P8N9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cyp2d40Q6P8N9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cyp2d40Q6P8N9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cyp2d40Q6P8N9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cyp2d40Q6P8N9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cyp2d40Q6P8N9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cyp2d40Q6P8N9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cyp2d40Q6P8N9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cyp2d40Q6P8N9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cyp2d40Q6P8N9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cyp2d40Q6P8N9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cyp2d40Q6P8N9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cyp2d40Q6P8N9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cyp2d40Q6P8N9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp2d40Q6P8N9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp2d40Q6P8N9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp2d40Q6P8N9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp2d40Q6P8N9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp2d40Q6P8N9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp2d40Q6P8N9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp2d40Q6P8N9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp2d40Q6P8N9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp2d40Q6P8N9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Cyp2d40Q6P8N9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cyp2d40Q6P8N9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cyp2d40Q6P8N9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cyp2d40Q6P8N9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cyp2d40Q6P8N9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cyp2d40Q6P8N9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cyp2d40Q6P8N9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cyp2d40Q6P8N9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cyp2d40Q6P8N9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cyp2d40Q6P8N9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp2d40Q6P8N9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp2d40Q6P8N9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp2d40Q6P8N9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp2d40Q6P8N9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp2d40Q6P8N9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp2d40Q6P8N9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp2d40Q6P8N9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp2d40Q6P8N9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp2d40Q6P8N9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp2d40Q6P8N9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp2d40Q6P8N9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp2d40Q6P8N9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp2d40Q6P8N9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp2d40Q6P8N9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp2d40Q6P8N9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp2d40Q6P8N9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp2d40Q6P8N9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyp2d40Q6P8N9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyp2d40Q6P8N9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyp2d40Q6P8N9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyp2d40Q6P8N9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyp2d40Q6P8N9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms