Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
LMOD2Q6P5Q4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
LMOD2Q6P5Q4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
LMOD2Q6P5Q4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
LMOD2Q6P5Q4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
LMOD2Q6P5Q4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
LMOD2Q6P5Q4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
LMOD2Q6P5Q4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
LMOD2Q6P5Q4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
LMOD2Q6P5Q4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
LMOD2Q6P5Q4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
LMOD2Q6P5Q4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
LMOD2Q6P5Q4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
LMOD2Q6P5Q4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
LMOD2Q6P5Q4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
LMOD2Q6P5Q4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
LMOD2Q6P5Q4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
LMOD2Q6P5Q4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
LMOD2Q6P5Q4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
LMOD2Q6P5Q4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
LMOD2Q6P5Q4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
LMOD2Q6P5Q4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
LMOD2Q6P5Q4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
LMOD2Q6P5Q4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
LMOD2Q6P5Q4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
LMOD2Q6P5Q4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
LMOD2Q6P5Q4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
LMOD2Q6P5Q4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
LMOD2Q6P5Q4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
LMOD2Q6P5Q4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
LMOD2Q6P5Q4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
LMOD2Q6P5Q4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
LMOD2Q6P5Q4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
LMOD2Q6P5Q4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
LMOD2Q6P5Q4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
LMOD2Q6P5Q4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
LMOD2Q6P5Q4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
LMOD2Q6P5Q4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
LMOD2Q6P5Q4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
LMOD2Q6P5Q4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
LMOD2Q6P5Q4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
LMOD2Q6P5Q4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
LMOD2Q6P5Q4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
LMOD2Q6P5Q4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
LMOD2Q6P5Q4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
LMOD2Q6P5Q4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
LMOD2Q6P5Q4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
LMOD2Q6P5Q4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
LMOD2Q6P5Q4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
LMOD2Q6P5Q4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
LMOD2Q6P5Q4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
LMOD2Q6P5Q4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
LMOD2Q6P5Q4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
LMOD2Q6P5Q4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC33.17■■■□□ 2.9
LMOD2Q6P5Q4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
LMOD2Q6P5Q4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
LMOD2Q6P5Q4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
LMOD2Q6P5Q4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
LMOD2Q6P5Q4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
LMOD2Q6P5Q4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
LMOD2Q6P5Q4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
LMOD2Q6P5Q4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
LMOD2Q6P5Q4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
LMOD2Q6P5Q4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
LMOD2Q6P5Q4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
LMOD2Q6P5Q4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
LMOD2Q6P5Q4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
LMOD2Q6P5Q4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
LMOD2Q6P5Q4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
LMOD2Q6P5Q4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
LMOD2Q6P5Q4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
LMOD2Q6P5Q4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
LMOD2Q6P5Q4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
LMOD2Q6P5Q4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
LMOD2Q6P5Q4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
LMOD2Q6P5Q4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
LMOD2Q6P5Q4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
LMOD2Q6P5Q4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
LMOD2Q6P5Q4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
LMOD2Q6P5Q4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
LMOD2Q6P5Q4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
LMOD2Q6P5Q4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
LMOD2Q6P5Q4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
LMOD2Q6P5Q4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
LMOD2Q6P5Q4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
LMOD2Q6P5Q4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
LMOD2Q6P5Q4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
LMOD2Q6P5Q4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
LMOD2Q6P5Q4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
LMOD2Q6P5Q4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
LMOD2Q6P5Q4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
LMOD2Q6P5Q4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
LMOD2Q6P5Q4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
LMOD2Q6P5Q4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
LMOD2Q6P5Q4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
LMOD2Q6P5Q4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
LMOD2Q6P5Q4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC33.07■■■□□ 2.88
LMOD2Q6P5Q4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
LMOD2Q6P5Q4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC33.07■■■□□ 2.88
LMOD2Q6P5Q4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms